针对您提出的“员工合同到期医疗也到了，但是还在请病假，不续签怎么操作”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、法律依据与合同状态
首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，当员工处于规定的医疗期内时，即使劳动合同到期，用人单位也不能单方面终止合同。劳动合同应当延续至医疗期满，这是法律对员工在医疗期间的一种保护。
二、企业操作建议
及时沟通：
- 在劳动合同到期前，企业应主动与员工或其家属取得联系，了解员工的病情及预计恢复时间。
- 向员工明确说明，由于其在医疗期内，劳动合同将自动顺延至医疗期结束。
书面通知：
- 企业应通过书面形式（如邮件、信函等）向员工发送《劳动合同顺延通知书》。
- 通知书中应明确顺延的期限、双方的权利义务，并要求员工签字确认。
保留证据：
- 企业应妥善保存员工的医疗证明、沟通记录、通知书回执等材料。
- 这些材料在后续可能发生的争议处理中，将作为重要的证据。
协商新约或调整：
- 若医疗期结束后，员工仍需长期治疗或无法从事原工作，企业可与员工协商签订新的劳动合同或变更合同条款（如调整岗位）。
三、员工注意事项
提供医疗证明：
- 员工应及时向企业提供医院出具的诊断书、休假建议书等文件，以证明其医疗期的合法性。
关注通知内容：
- 员工在收到企业的顺延通知后，应仔细核对顺延期限是否符合法律规定。
- 如有疑问或不明确的地方，员工可寻求法律帮助或咨询专业人士。
主动沟通：
- 若员工因特殊原因无法按时返岗，应提前与企业协商解决方案。
- 避免因未及时沟通而被视为旷工或违反公司规定。
四、特殊情况处理
医疗期届满仍无法工作：
- 若员工医疗期满后仍不能从事原工作或企业另行安排的工作，企业可依据《劳动合同法》的相关规定解除劳动合同。
- 但在此之前，企业需提前30日书面通知员工，并支付相应的经济补偿金。
员工拒绝续签：
- 若医疗期结束后，员工主动提出不续签合同，企业则无需支付补偿金。
- 但企业应结清员工的工资、办理离职手续，并确保双方权益得到妥善处理。
五、风险防范建议
完善制度：
- 企业应制定明确的医疗期管理制度，规范流程操作，以减少潜在的法律风险。
法律咨询：
- 在处理复杂或敏感的医疗期合同问题时，建议企业聘请专业律师进行审核和指导。
人性化关怀：
- 在合法合规的前提下，企业应体现对员工的人文关怀，如提供必要的帮助和支持。
综上所述，当员工合同到期但医疗期未满且仍在请病假时，企业应依法顺延劳动合同至医疗期满，并与员工保持良好沟通。如遇特殊情况或争议，建议及时寻求法律帮助以确保双方权益得到妥善处理。