针对您因身体不舒服向公司请假两个月，回来后公司要求重新办理入职合同的情况，以下是我的法律分析和建议：

1. 公司要求重新办理入职合同的合法性：

   • 一般情况下，员工请假（包括病假）并不导致劳动合同的终止或需要重新签订。劳动合同是双方约定劳动关系的法律文件，除非有法定或约定的解除事由，否则应持续有效。
   • 如果公司仅因您请假两个月就要求重新办理入职合同，这可能缺乏法律依据。除非在请假期间，您的劳动合同已经到期且未续签，或者公司有合理的理由认为您已不再适合原岗位并决定解除原合同后重新招聘，但这种情况较为罕见且需要符合法定程序。

2. 可能涉及的法律问题：

   • 劳动合同的变更与解除：如果公司确实需要变更或解除与您的劳动合同，应遵循《劳动合同法》的相关规定，如提前通知、支付经济补偿等。
   • 病假期间的权益保护：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工在医疗期内享有病假工资、医疗待遇等权益。公司不应因员工请假而剥夺这些权益。
   • 歧视与不公平对待：如果公司仅因您请假就采取不利措施，如要求重新办理入职合同、降低薪资或职位等，可能构成对员工的歧视或不公平对待。

3. 建议与行动步骤：

   • 与公司沟通：首先，建议您与公司人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解公司要求重新办理入职合同的具体原因和依据。
   • 审查劳动合同：仔细审查您的劳动合同，了解其中关于请假、合同变更与解除等条款的规定。
   • 寻求法律援助：如果公司坚持要求重新办理入职合同且您认为这不合理或违法，您可以咨询专业律师（比如我）或向当地劳动监察部门投诉。
   • 保留证据：在沟通过程中，注意保留相关证据，如邮件、聊天记录、请假条等，以备不时之需。

4. 可能的法律后果：

   • 如果公司未经合法程序就解除或变更与您的劳动合同，您可能有权要求公司继续履行合同、支付违法解除劳动合同的赔偿金等。
   • 如果公司存在歧视或不公平对待的行为，您可能还有权要求公司承担相应的法律责任。

总结来说，公司仅因您请假两个月就要求重新办理入职合同可能缺乏法律依据。建议您先与公司沟通了解原因，并审查劳动合同的相关条款。如果认为公司的行为不合理或违法，您可以寻求法律援助或向相关部门投诉。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。