结论：小餐馆员工8月份请了两天假，餐馆扣没来上班的两天工资是否合法，需结合具体情况分析，但一般情况下，仅扣未出勤天数的工资是合法的，若额外扣除其他天数工资则可能不合法。员工要求发29天工资（假设8月有31天，员工实际出勤29天中的27天或28天等，具体需看请假天数与出勤天数关系，此处按员工实际应出勤31天，请假2天，要求发29天工资理解），也需根据实际出勤情况及餐馆规定来判断。
法律分析：
工资支付原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，餐馆应支付员工实际出勤天数的工资，不得无故克扣。
请假与工资扣除：
- 员工请了两天假，餐馆扣除这两天未出勤的工资是合理的，因为员工未提供劳动，餐馆无需支付这部分工资。
- 若餐馆额外扣除员工其他天数的工资（如以旷工一天扣三天工资的方式），则可能违反法律规定。因为除了给餐馆造成经济损失外，餐馆不得额外扣工资。
员工要求发29天工资：
- 员工要求发29天工资，需看其实际出勤情况。若员工8月份实际出勤29天（假设8月有31天，员工请假2天），则餐馆应支付29天的工资。
- 若员工实际出勤天数少于29天（如因其他原因缺勤），则餐馆无需支付未出勤天数的工资。
建议与后果：
餐馆方面：
- 餐馆应制定合理的考勤和工资支付制度，明确请假与工资扣除的规定。
- 餐馆在扣除员工工资时，应确保扣除的金额与员工未出勤的天数相符，不得无故克扣。
员工方面：
- 员工应了解自己的出勤情况和餐馆的工资支付制度。
- 若员工认为餐馆扣除的工资不合理，可以与餐馆协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
可能法律后果：
- 若餐馆无故克扣员工工资，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令支付工资、加付赔偿金等。
- 员工若因工资问题与餐馆发生争议，可以通过法律途径维护自己的合法权益。
具体计算（假设8月有31天，员工月工资为X元）：
- 若员工实际出勤29天，请假2天，则餐馆应支付的工资为：\(X \times \frac{29}{31}\)（按实际出勤天数比例计算）。
- 若餐馆额外扣除员工工资，如以旷工一天扣三天工资的方式扣除，则可能违反法律规定，员工有权要求餐馆补发被扣除的工资。
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