当仲裁委员会立案后又撤销案件时，劳动者可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

一、明确撤销原因

首先，劳动者需要了解仲裁委员会撤销案件的具体原因。这通常包括：

1. 申请人自愿撤回：如果劳动者（或用人单位）在仲裁过程中自愿撤回了仲裁申请，那么仲裁委员会会根据申请人的意愿撤销案件。这种情况下，劳动者需要明确撤回是否是出于自愿，以及撤回后是否还能基于同一事实和理由再次申请仲裁（通常不能，除非有新的事实和理由）。

2. 仲裁委员会自身原因：如仲裁程序违法、仲裁员回避事由未回避等，仲裁委员会可能会主动撤销案件。这种情况下，劳动者可以向仲裁委员会提出异议，要求重新审理，并提供相关证据支持。

3. 其他法定事由：如不可抗力等不可预见事由导致案件无法继续进行，仲裁委员会也可能会撤销案件。这种情况下，劳动者可以待事由消除后，向仲裁委员会申请恢复仲裁程序。

二、根据撤销原因采取相应措施

1. 若因自愿撤回而撤销：

   • 劳动者需要评估撤回是否明智，以及是否还有必要继续追究。
   • 如果认为撤回是出于误解或被迫，可以收集相关证据（如聊天记录、证人证言等），向仲裁委员会说明情况，申请恢复仲裁程序。
   • 如果确实需要再次申请仲裁，应确保有新的事实和理由，并准备好相应的证据材料。

2. 若因仲裁委员会自身原因而撤销：

   • 劳动者可以向仲裁委员会提出书面异议，要求重新审理案件。
   • 提供相关证据证明仲裁程序存在违法或不当之处。
   • 如果仲裁委员会拒绝重新审理，劳动者可以向有管辖权的人民法院申请司法监督或提起诉讼。

3. 若因其他法定事由而撤销：

   • 劳动者需要等待事由消除后，及时向仲裁委员会申请恢复仲裁程序。
   • 提供相关证明材料（如不可抗力事件的证明文件等）。

三、考虑后续法律途径

1. 申请司法监督：如果劳动者认为仲裁委员会的撤销决定存在错误或不当之处，可以向有管辖权的人民法院申请司法监督。

2. 提起诉讼：如果仲裁案件被撤销后，劳动者仍然希望追究用人单位的责任，可以根据具体情况向人民法院提起诉讼。在提起诉讼前，劳动者需要准备好充分的证据材料，并咨询专业律师的意见。

四、注意事项

1. 保持冷静和理性：面对仲裁案件被撤销的情况，劳动者需要保持冷静和理性，不要盲目采取行动。

2. 及时咨询专业律师：由于劳动仲裁和诉讼涉及复杂的法律程序和证据规则，劳动者在处理此类问题时应及时咨询专业律师的意见。

3. 充分准备证据材料：无论采取哪种法律途径，劳动者都需要充分准备证据材料来支持自己的主张。这包括合同、工资单、考勤记录、证人证言等。

举例说明：假设劳动者因用人单位未支付加班费而申请了劳动仲裁。在仲裁过程中，劳动者因某种原因自愿撤回了仲裁申请。但后来劳动者发现撤回申请是出于误解或被迫，且用人单位仍然未支付加班费。此时，劳动者可以收集相关证据（如与用人单位的沟通记录、证人证言等），向仲裁委员会说明情况，申请恢复仲裁程序。如果仲裁委员会拒绝恢复，劳动者可以向人民法院申请司法监督或提起诉讼来维护自己的合法权益。