当违法分包合同被认定为无效，且中途出现退场情况时，工程款的计算确实是一个复杂且需要细致处理的问题。以下是我为您详细梳理的工程款计算方法与依据：
一、基本原则
验收合格原则：
- 若建设工程已经竣工并验收合格，那么承包人（尽管合同无效）仍有权请求参照合同约定来支付工程价款。这一原则是基于相关司法解释的规定，旨在保护实际完成工程并达到质量标准的承包人的利益。
验收不合格处理原则：
- 若建设工程经验收不合格，则需要根据修复情况来处理。修复后合格的，发包人可以请求承包人承担修复费用，并参照合同约定支付工程价款（扣除修复成本）。
- 若修复后仍不合格，则承包人无权请求支付工程价款。
二、具体计算方法
参照合同约定结算：
- 在合同无效但工程质量合格的情况下，法院通常会参照合同中关于工程价款的约定进行计算，包括单价、总价、付款方式等条款。这是处理此类纠纷时的一种常见做法。
按照实际履行情况结算：
- 若合同对工程量或价款约定不明确，或存在争议，则可根据实际完成的工程量进行计算。这需要双方提供施工记录、验收报告等证据材料来支持各自的诉求。
- 实际履行情况还包括因实际施工产生的合理费用，如材料费、人工费等。
考虑市场价格因素：
- 在某些情况下，如合同约定的价款明显低于市场价格或显失公平，法院可能会参考当地同期同类工程的市场价格进行计算，以确保结算的公平性和合理性。
鉴定机构评估：
- 对于复杂的工程或存在争议的价款问题，法院可能会委托专业的鉴定机构进行评估。鉴定结果将作为计算工程款的重要依据，有助于解决双方之间的分歧。
三、其他考虑因素
利息损失赔偿：
- 若发包人未按时支付工程款，承包人有权要求赔偿因此造成的利息损失。利息的计算通常按照中国人民银行发布的同期同类贷款利率进行。
违约责任承担：
- 尽管合同无效，但若一方因过错给对方造成损失的，仍应承担相应的赔偿责任。例如，因发包人的原因导致工程停工、窝工的，发包人应赔偿承包人因此造成的损失。
管理费与利润的处理：
- 在违法分包的情况下，由于合同本身无效，承包人可能无法主张管理费与利润部分。这部分费用的计算通常依赖于合同约定及实际施工情况，但在合同无效时，其主张往往难以得到支持。
四、实际操作建议
- 收集证据：双方应尽可能收集与工程相关的所有证据材料，如施工记录、验收报告、付款凭证等，以便在纠纷发生时能够提供有力的支持。
- 协商解决：在纠纷发生初期，双方可以尝试通过协商来解决分歧，以避免不必要的法律诉讼和成本支出。
- 寻求法律帮助：若协商无果，双方可以寻求专业的法律帮助，通过法律途径来维护自己的合法权益。
综上所述，当违法分包合同被认定为无效且中途退场时，工程款的计算需要综合考虑多个因素，并遵循相关法律法规及司法实践中的处理原则。希望以上解答能够对您有所帮助。