当违法分包合同被认定为无效后，作为实际施工人，您要追索工程款，可以遵循以下步骤和原则来进行：

一、明确追索对象及顺序

1. 优先向直接合同相对方主张权利：

   • 您应首先依据与违法分包人签订的合同（尽管合同可能无效，但司法实践中常参照合同约定结算工程款）向其主张工程款。
   • 根据《民法典》合同编的规定，当事人应按约定履行义务。若违法分包人未按约支付工程款，您有权要求其承担违约责任（在合同无效但工程质量合格的情况下，此处的“违约责任”主要体现为参照合同约定支付工程款）。

2. 突破合同相对性向发包人主张权利：

   • 若违法分包人无力支付或下落不明，您可依法向发包人追索。
   • 法定情形包括：发包人明知违法分包仍允许施工；工程已竣工验收合格；您能证明工程量及价款。
   • 法律依据：《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第四十三条规定，实际施工人以发包人为被告主张权利的，法院应予支持。

3. 特定情形下可向总承包人或转包人主张权利：

   • 若存在多层转包/分包关系，您可要求与其有直接或间接合同关系的上游主体承担责任。
   • 例如，总承包人将工程违法分包给A，A再转包给您（实际施工人），此时您可同时起诉A和总承包人。
   • 责任范围：各责任人按过错程度分担付款义务，发包人在欠付工程款范围内承担连带责任。

二、工程款计算方法

1. 参照合同约定：

   • 在合同无效但工程质量合格的情况下，法院通常会参照合同中关于工程价款的约定进行计算，包括单价、总价、付款方式等条款。

2. 实际施工量：

   • 若合同对工程量或价款约定不明确，或存在争议，可根据实际完成的工程量进行计算。
   • 这需要您提供施工记录、验收报告等证据材料来支持您的主张。

3. 市场价格：

   • 在某些情况下，如合同约定的价款明显低于市场价格或显失公平，法院可能会参考当地同期同类工程的市场价格进行计算。

4. 鉴定机构评估：

   • 对于复杂的工程或存在争议的价款问题，法院可能会委托专业的鉴定机构进行评估。
   • 鉴定结果将作为计算工程款的重要依据。

三、其他考虑因素

1. 利息损失：

   • 若发包人或违法分包人未按时支付工程款，您有权要求赔偿因此造成的利息损失。
   • 利息的计算通常按照中国人民银行发布的同期同类贷款利率进行。

2. 违约责任（在合同无效语境下的特殊理解）：

   • 虽然合同无效，但若因对方过错（如违法分包、未按时支付工程款等）给您造成损失的，您仍应有权要求对方承担相应的赔偿责任。

3. 管理费与利润：

   • 在违法分包的情况下，由于合同本身无效，您可能无法主张管理费与利润部分。
   • 这部分费用的计算通常依赖于合同约定及实际施工情况，但在合同无效时，其主张往往难以得到支持。

四、实际操作建议

1. 收集证据：

   • 收集与违法分包人签订的合同、施工记录、验收报告、工程量清单、付款凭证等证据材料。
   • 这些证据将有助于您证明工程量、价款以及对方未按时支付工程款的事实。

2. 咨询专业律师：

   • 鉴于违法分包合同无效后的工程款追索问题涉及复杂的法律关系和司法实践，建议您咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。

3. 提起诉讼或申请仲裁：

   • 若与对方协商无果，您可依法向法院提起诉讼或根据合同约定申请仲裁来追索工程款。

希望以上解答能对您有所帮助。在实际操作中，请务必根据具体情况和法律法规来行事，并咨询专业律师以获取更准确的法律建议。