员工因请假时间过长被迫写辞职单，这一行为是否违法需视具体情况而定。以下是从不同角度进行的分析：
一、用人单位规章制度合法性角度
规章制度合法合理且已公示：
- 若用人单位的规章制度中明确规定了请假超时的处理方式，包括解除劳动合同，且该规定不违反法律法规的强制性规定，同时用人单位有证据证明员工知晓该规定（如通过培训、签收等方式），那么在这种情况下，按照规章制度处理可能具有一定合理性。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
规章制度存在瑕疵：
- 如果用人单位的规章制度未经民主程序制定或未有效公示，或者该处理方式明显不合理、过重，不符合公平原则，那么迫使员工离职的行为可能被认定为违法解除劳动合同。
- 法律后果：员工有权要求用人单位支付违法解除劳动合同的赔偿金，赔偿金的标准通常为经济补偿标准的二倍。
二、请假超时与劳动合同解除的合理性角度
请假超时作为解除劳动合同的直接原因：
- 仅因请假超时就直接迫使员工离职，可能存在违法风险。因为请假超时并不一定构成严重违反用人单位规章制度的行为，除非该行为对用人单位的生产经营造成了重大影响。
综合考虑其他因素：
- 用人单位在决定是否解除劳动合同时，应综合考虑员工的请假原因、请假时长、对工作的影响以及员工过往的表现等因素。如果员工因特殊原因（如疾病、家庭紧急情况等）请假超时，且该行为并非故意或恶意，那么用人单位应给予一定的理解和宽容。
三、建议与措施
对于员工：
- 如果因请假超时被要求写辞职单，应首先查看用人单位的规章制度，确认该规定是否合法合理且已公示。
- 如果认为用人单位的处理方式不合理或违法，可以与用人单位进行协商，要求继续履行劳动合同或支付赔偿金。
- 如果协商无果，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。
对于用人单位：
- 应制定合法合理的规章制度，并确保已向员工公示告知。
- 在处理员工请假超时等问题时，应综合考虑多种因素，避免简单粗暴地解除劳动合同。
- 如果确实需要解除劳动合同，应确保解除行为符合法律法规的规定，并支付相应的经济补偿或赔偿金。
总结来看，员工因请假时间过长被迫写辞职单是否违法，关键在于用人单位的处理方式是否符合法律法规及自身规章制度的规定，以及是否遵循公平合理原则。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。