工厂只负责员工进入而不管理员工离职或退出的情况，这实际上涉及到了员工离职流程的管理问题，而非单纯的工资福利问题，但我会从员工权益保护的角度给出建议。针对这种情况，员工可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

一、与工厂沟通

1. 明确要求：员工首先应当私下联系工厂的管理层或人力资源部门，明确要求工厂按照法律规定和内部规章制度，为员工办理离职手续，包括但不限于开具离职证明、结算工资、办理社保关系转移等。
2. 协商赔偿：如果因为工厂未及时办理离职手续导致员工遭受损失，如无法及时办理失业登记、社保关系无法转移等，员工可以与工厂协商赔偿问题。

二、向劳动监察部门投诉

1. 投诉渠道：如果与工厂沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对工厂的违法行为进行调查，并要求其改正。
2. 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在解除或终止劳动合同时，应当向劳动者出具解除或终止劳动合同的书面证明。如果工厂未履行这一义务，劳动行政部门有权责令其改正，并可能对工厂进行处罚。

三、申请劳动仲裁或提起诉讼

1. 劳动仲裁：在向劳动监察部门投诉后，如果问题仍未得到解决，员工可以向当地劳动仲裁委员会提起劳动仲裁。劳动仲裁委员会将依法进行裁决，要求工厂为员工办理离职手续，并可能赔偿因此给员工造成的损失。
2. 提起诉讼：如果劳动仲裁未能解决问题，员工还可以依法向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，员工需要提供充分的证据来证明工厂的违法行为以及自己因此遭受的损失。法院将依法进行判决，维护员工的合法权益。

四、注意事项

1. 保留证据：在整个过程中，员工应当注意保留相关证据，如与工厂的沟通记录、投诉材料、劳动仲裁或诉讼的相关文件等。这些证据将在后续的法律程序中发挥重要作用。
2. 及时行动：员工在发现工厂存在违法行为时，应当及时采取行动，避免因为拖延时间而导致损失扩大。

工厂只负责员工进入而不管理员工离职或退出的情况是不合法的，员工有权要求工厂按照法律规定和内部规章制度为自己办理离职手续。如果工厂拒绝履行义务，员工可以通过与工厂沟通、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。