针对您提出的“在职员工犯罪后还有工资吗以及如何处理”的问题，这是一个涉及劳动法、劳动合同以及具体案件情况的综合问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、在职员工犯罪后工资的处理原则
在职员工犯罪后，其工资的处理情况确实较为复杂，主要依据法律法规、劳动合同以及用人单位的相关规定和处理决定。一般来说，如果员工因犯罪被采取强制措施或被追究刑事责任，用人单位有权根据相关规定暂停其工作并停发工资。
二、具体处理情况
被采取强制措施或追究刑事责任期间：
- 根据《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第28条规定，劳动者涉嫌违法犯罪被有关机关收容审查、拘留或逮捕的，用人单位在劳动者被限制人身自由期间，可与其暂时停止劳动合同的履行。
- 在此期间，用人单位不承担劳动合同规定的相应义务，包括支付工资。
最终被认定有罪并被判刑：
- 若员工最终被认定有罪并被依法判刑，用人单位通常有权解除劳动合同，此时工资发放也会相应停止。
- 但如果员工犯罪情节轻微且未对工作造成重大影响，用人单位经评估后决定继续留用，那么工资发放的具体安排可由双方协商确定。
错误限制人身自由的情况：
- 如果劳动者经证明被错误限制人身自由的，暂时停止履行劳动合同期间劳动者的损失，可由其依据《国家赔偿法》要求有关部门赔偿。
三、用人单位的操作建议
暂停工资发放：
- 在员工被采取强制措施或追究刑事责任期间，用人单位可以暂停其工资发放，但应确保此举符合法律法规和劳动合同的规定。
解除劳动合同：
- 若员工最终被认定有罪并被判刑，用人单位应依法解除劳动合同，并停止工资发放。
协商工资发放：
- 如果员工犯罪情节轻微且用人单位决定继续留用，双方应协商确定工资发放的具体安排，确保既符合法律法规又体现公平合理。
四、员工权益保护
- 员工在面临此类情况时，应了解自己的合法权益，包括但不限于工资支付、劳动合同解除等。
- 如果员工认为用人单位的处理决定侵犯了自己的合法权益，可以通过法律途径进行维权，如申请劳动仲裁或提起诉讼。
综上所述，在职员工犯罪后工资的处理需综合多方面因素考量，包括法律法规、劳动合同以及用人单位的相关规定和处理决定。希望以上解答能对您有所帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时咨询。