出口税务函调不通过，如果工厂存在违约行为导致退税款损失，可以起诉工厂要求赔偿退税款。以下是对此问题的详细分析：
一. 案情分析
出口税务函调不通过的原因：
- 出口税务函调是税务机关为了防范骗税，对出口企业的供货商所属税务机关发函，调查其物流、资金流、纳税情况等真实性的一种手段。
- 函调不通过可能的原因包括但不限于：供货商提供的信息与税务机关掌握的信息不一致，供货商存在偷逃税款等违法行为，或者出口企业的交易本身存在瑕疵等。
工厂的责任：
- 如果工厂作为供货商，在提供货物或服务的过程中，未能按照合同约定或法律规定提供真实、准确的信息，导致出口企业的退税申请被税务机关拒绝，那么工厂可能构成违约。
- 违约行为的具体表现可能包括：提供虚假的增值税专用发票、发货单、出库单等凭证，或者存在其他隐瞒、欺骗行为等。
退税款损失与工厂违约行为的因果关系：
- 出口企业因退税申请被拒绝而遭受的退税款损失，必须与工厂的违约行为存在直接的因果关系。
- 这意味着，如果退税款损失是由于工厂提供的虚假信息或其他违约行为直接导致的，那么出口企业有权要求工厂承担赔偿责任。
二. 法律依据
- 根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条：“当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。”
- 如果工厂作为供货商存在违约行为，导致出口企业的退税款损失，那么工厂应当承担相应的违约责任，包括赔偿退税款损失等。
三. 起诉要求与证据准备
起诉要求：
- 出口企业可以向人民法院提起诉讼，要求工厂承担违约责任，赔偿因退税款损失而产生的经济损失。
- 具体的赔偿金额应当根据实际损失情况来确定，包括退税款本金、利息以及因追索债务而产生的合理费用等。
证据准备：
- 出口企业需要准备充分的证据来证明工厂的违约行为以及因违约行为导致的退税款损失。
- 证据可能包括但不限于：购销合同、增值税专用发票、发货单、出库单等凭证、税务机关的函调结果及复函、退税申请被拒绝的通知等。
四. 诉讼程序与风险提示
诉讼程序：
- 出口企业应当向人民法院递交起诉状，并按照法律规定缴纳诉讼费用。
- 人民法院将依法组织开庭审理，并根据事实和法律作出判决。
- 如果判决结果有利于出口企业，工厂应当按照判决结果履行赔偿责任；如果判决结果不利于出口企业，出口企业有权依法提起上诉。
风险提示：
- 诉讼过程可能存在一定的风险和不确定性，包括但不限于：证据不足导致败诉、工厂无力承担赔偿责任等。
- 因此，在决定提起诉讼之前，出口企业应当充分评估诉讼风险，并考虑是否采取其他替代性争议解决方式（如调解、仲裁等）来维护自身合法权益。
我的观点：如果出口税务函调不通过是由于工厂存在违约行为导致的退税款损失，那么出口企业有权依据《中华人民共和国民法典》的相关规定向人民法院提起诉讼，要求工厂承担赔偿责任。然而，在提起诉讼之前，出口企业应当充分准备证据，评估诉讼风险，并考虑是否采取其他替代性争议解决方式。如有进一步需要，您可以继续咨询我。