干了20天被扣3天工资，是否合法需要分情况来看：

1. 劳动合同有明确约定：

   • 如果劳动合同中明确约定了，工作不满一定期限（如两个月）要扣相应天数（如三天）的工资，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么在这种情况下，用人单位扣工资的行为是合法的。因为劳动者与用人单位签订劳动合同时，就应当遵守合同中的各项条款。但需要注意的是，这种约定必须合法且合理，不能过分侵犯劳动者的权益。

2. 未约定但规章制度有规定：

   • 如果用人单位依法制定并公示的规章制度中，有关于工作不满一定期限扣工资的规定，且该规定经过民主程序制定，不违反法律法规，那么也是有一定合理性的。不过，即使有此规定，扣工资的行为也应当合理、适度，不能过分苛刻。

3. 既无合同约定也无制度规定：

   • 在这种情况下，用人单位扣三天工资是不合法的。工资是劳动者付出劳动应得的报酬，用人单位不得随意克扣。根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。

法律建议与应对措施：

• 协商解决：首先，你可以尝试与用人单位进行协商，要求其补发被扣除的工资。这是解决纠纷最直接且成本较低的方式。

• 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门进行投诉。劳动监察部门将依法对用人单位进行调查和处理，要求用人单位限期支付工资，并可能加付赔偿金。

• 提起劳动仲裁或诉讼：若投诉仍无法解决问题，你可以选择提起劳动仲裁或诉讼。通过法律程序，你可以要求用人单位承担法律责任，并追回被扣除的工资。

可能面临的法律后果：

• 如果用人单位被认定为克扣或无故拖欠工资，根据《劳动保障监察条例》第二十六条的规定，劳动保障行政部门将责令其限期支付劳动者的工资报酬，并可能按照应付金额50％以上1倍以下的标准计算，向劳动者加付赔偿金。

总结与提醒：

• 干了20天被扣3天工资是否合法，取决于劳动合同、规章制度以及相关法律法规的规定。在遭遇此类情况时，建议你首先了解自己的权益和用人单位的规定，然后尝试与用人单位协商解决。如果协商无果，可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁、诉讼来维护自己的合法权益。

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