干九天扣三天工资是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：

一、法律依据与工资保障

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条以及《中华人民共和国劳动合同法》第三十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，劳动者的劳动报酬受法律严格保护，用人单位必须按照实际出勤情况支付工资，不能随意扣除。

二、旷工与工资扣除的合理范围

旷工是劳动者违反劳动纪律的行为，用人单位有权依据规章制度进行相应处理，比如不支付旷工期间的工资。然而，处理的方式应当合法、合理，不能随意扩大扣薪的范围和额度。具体来说：

• 员工工作一天应获得一天的工资，相应地，缺勤一天，用人单位可以不支付当天的工资。
• 但规定干九天扣三天工资，实际上超出了旷工期间未提供劳动的合理范围，构成了对劳动者劳动报酬权益的侵害。因为旷工三天并不等同于造成了三天的额外经济损失或工作缺失，用人单位不能以此为由进行惩罚性扣薪。

三、合法扣工资的情形与限制

在特定情况下，如因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可以按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但根据《工资支付暂行规定》第十六条的规定，经济损失的赔偿可从劳动者本人的工资中扣除，且每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。这一规定限制了用人单位扣除劳动者工资的额度，保护了劳动者的合法权益。

四、劳动者的维权途径

如果劳动者遇到不合理扣工资的情况，可以采取以下措施维护自己的合法权益：

1. 与用人单位协商：首先尝试与用人单位沟通协商，了解扣薪的具体原因和依据，并寻求合理的解决方案。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商不成，可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
3. 申请劳动仲裁：在必要时，可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。

五、建议与提醒

• 了解公司规章制度：劳动者应仔细阅读公司的规章制度，了解关于旷工和扣薪的具体规定。如果发现规章制度存在不合理之处，可以与用人单位进行沟通协商或提出修改建议。
• 保留证据：在发生争议时，劳动者应保留好相关证据，如考勤记录、工资单、劳动合同等。这些证据有助于在维权过程中证明自己的权益受到侵害。
• 依法维权：在维护自己合法权益的过程中，劳动者应依法行事，避免采取过激或违法的行为。

综上所述，干九天扣三天工资的做法违反了相关法律法规，用人单位应严格遵守法律规定，确保员工的合法权益得到充分保障。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。