结论：在厂里面干了5天扣3天工资的行为，一般是不合法的，但具体还需根据劳动合同、公司规章制度以及相关法律法规来综合判断。

分析：

1. 劳动合同与规章制度：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则订立劳动合同。劳动合同中应当明确约定劳动报酬、工作时间、休息休假等条款。
   • 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了工资的计算方式和扣除条件，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位按照这些规定扣除工资可能是合法的。但在此案例中，仅干了5天就扣除3天工资，显然不符合一般的工资计算逻辑，除非劳动合同或规章制度中有特别约定。

2. 法律法规的强制性规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者享有取得劳动报酬的权利，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
   • 除非劳动者存在严重违反公司规章制度、给公司造成重大损失等法定情形，否则用人单位不得随意扣除劳动者工资。在此案例中，仅干了5天就扣除3天工资，很难被视为合法扣除，除非能证明劳动者存在严重过错或违反规定。

3. 实际操作中的合法性判断：

   • 在实际操作中，判断用人单位扣除工资是否合法，需要综合考虑劳动合同、公司规章制度、相关法律法规以及劳动者的实际行为等因素。
   • 如果用人单位无法提供合法依据来支持其扣除工资的行为，那么该行为很可能被视为违法，劳动者有权要求用人单位补发被扣除的工资，并可能依法追究用人单位的法律责任。

建议：

• 如果你认为用人单位扣除工资的行为不合法，首先可以与用人单位进行协商，要求其补发被扣除的工资。
• 如果协商无果，你可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
• 在处理此类纠纷时，建议你保留好相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以便在需要时提供证明。

可能后果：

• 如果用人单位扣除工资的行为被认定为违法，那么其可能需要承担补发工资、支付赔偿金等法律责任。
• 同时，用人单位的违法行为还可能受到劳动监察部门的处罚，影响其企业形象和信誉。