结论前置：厂里一天没去扣三天工资的做法，在大多数情况下是不合法的，严重侵犯了劳动者获得劳动报酬的权利。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国劳动法》第五十条：
- 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，用人单位必须按照劳动合同约定或法定标准支付工资，不能随意扣除。
《工资支付暂行规定》第十六条：
- 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。这一条款限制了用人单位扣款的金额和比例，并未授权“旷一罚三”的惩罚性扣款。
《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：
- 用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令。
二、合理性分析
违反比例原则：
- 旷工一天扣除三天工资，明显超出了旷工的实际天数和可能给用人单位造成的损失，这种处罚既不合理也不公平。例如，若员工日薪为300元，旷工一天被扣900元，显然远超实际损失。
涉嫌变相罚款：
- 根据《行政处罚法》，罚款权专属于行政机关。企业自行设定高额扣款，实质上构成了非法罚款，可能引发劳动纠纷。
损害劳动关系：
- 过度扣款会激化劳资矛盾，降低员工归属感，不利于建立和谐稳定的劳动关系。
三、用人单位的正确处理方式
完善规章制度：
- 用人单位应通过民主程序制定《员工手册》，明确旷工的认定标准和处分梯度，如首次警告、二次扣发当日工资、三次解除劳动合同等。
规范扣款流程：
- 扣款前须履行告知义务，出具书面通知并说明事由。扣款金额不得超过当月工资的20%，且不得低于最低工资标准。
建立申诉机制：
- 设立劳动争议调解委员会，对扣款异议进行公正裁决，保障员工救济权利。
四、劳动者的权益维护建议
与单位协商：
- 首先尝试与用人单位沟通，指出该规定的不合理和不合法性，要求按实际缺勤天数合理扣除工资，并返还多扣部分。
向劳动监察部门投诉：
- 协商不成时，可向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权监督检查用人单位遵守劳动保障法律情况，并对违法行为依法处理。
申请劳动仲裁：
- 若必要，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求支付被克扣的工资及经济补偿。申请时需提供劳动关系、出勤及工资发放等相关证据。
总结：厂里一天没去扣三天工资的做法不仅可能违反劳动法，还损害了劳动者的合法权益。作为劳动者，应了解自己的权利并采取适当措施维护；作为用人单位，则应确保规章制度符合法律法规，避免法律风险。双方应共同努力，营造和谐稳定的劳动关系环境。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。