针对您提出的“员工受伤，对方全责支付了医疗费，公司支付医疗费需要扣除对方赔付的部分吗”这一问题，以下是我的详细解答：

1. 核心结论：

   • 公司是否需要扣除对方已赔付的医疗费部分，主要取决于医疗费的支付主体以及相关法律法规的规定。

2. 详细分析：

   • 情况一：公司垫付医疗费

     • 如果公司在员工受伤后垫付了医疗费，且后续工伤赔偿款中包含医疗费用部分，那么公司通常有权从赔偿款中扣除之前垫付的医疗费。这是因为，符合标准的治疗费用应由工伤保险基金支付，扣除已垫付部分可以避免员工重复获利。
     • 法律依据：根据《工伤保险条例》及相关规定，治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。若公司已垫付了合理的医药费，且赔偿款中包含这部分费用，公司扣除垫付的医药费是合理的。

   • 情况二：员工自行支付医疗费

     • 如果员工在受伤后自行支付了医疗费，且后续工伤赔偿款中包含医疗费用部分，那么这部分赔偿款是对员工已支出费用的补偿，公司不应扣除。员工可获得这部分赔偿款以弥补自身损失。
     • 法律依据：同样基于《工伤保险条例》及相关规定，员工自行支付的医疗费，在获得工伤赔偿款时，应作为对其损失的补偿，不应被扣除。

   • 特殊情况：第三方全责

     • 在您提到的情况中，员工受伤是由第三方全责造成的，且第三方已支付了医疗费。此时，如果公司也垫付了医疗费，那么公司是否需要扣除第三方已赔付的部分，可能还需考虑公司垫付医疗费的性质、目的以及相关法律法规的具体规定。
     • 一般来说，如果公司垫付医疗费是出于人道主义或员工关怀，且未明确约定需从后续赔偿款中扣除，那么公司可能无权要求扣除第三方已赔付的部分。但具体还需根据案件实际情况和相关法律法规进行判断。

3. 法律建议：

   • 对于公司而言，在垫付员工医疗费时，应明确垫付的性质、目的以及后续处理方式，避免产生不必要的纠纷。
   • 对于员工而言，在获得工伤赔偿款时，应了解自己的权益和赔偿款的构成，确保自己的合法权益不受侵害。
   • 如果双方对医疗费扣除问题存在争议，建议及时咨询专业律师，以便根据案件实际情况和相关法律法规进行妥善处理。

4. 进一步思考：

   • 在处理此类问题时，还需考虑工伤保险基金的支付范围、支付标准以及支付程序等相关规定。
   • 同时，还需关注第三方全责情况下，公司垫付医疗费与第三方赔付之间的法律关系和责任划分问题。

综上所述，公司是否需要扣除对方已赔付的医疗费部分，需根据具体情况和相关法律法规进行判断。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。