您好，关于您提出的“工资总额是否包括扣款请假费用”的问题，我可以给您一个清晰、详细且有深度的解答。

首先，我们需要明确工资总额的定义。根据《劳动工资统计报表制度》的相关规定，工资总额是指用工单位在报告期内直接支付给从业人员的劳动报酬总额。这个定义强调了“直接支付”和“劳动报酬”两个关键点。

接下来，我们分析扣款请假费用是否应包含在工资总额中。扣款请假费用，通常是因为员工病假、事假等原因，单位从其应得工资中扣除的部分。这部分费用并不是单位直接支付给员工的劳动报酬，而是由于员工未能提供完整劳动而产生的扣款。

因此，结合工资总额的定义和扣款请假费用的性质，我们可以得出结论：工资总额不包括因病假、事假等情况产生的扣款。也就是说，在计算工资总额时，我们应以实际发放给本单位从业人员的劳动报酬为依据，而不应将扣款请假费用纳入其中。

以您提供的例子来说，如果员工全年计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资及特殊情况下支付的工资合计总额为60000元，而全年考勤扣款合计为1200元，那么该员工的工资总额应为60000元，而不是（60000-1200）元。在计算上一年度平均工资时，也应以60000元为基数进行计算。

希望这个解答能够让您对工资总额的计算有更清晰的认识。如果您还有其他问题或需要进一步的解释，请随时告诉我。