超时加班工资的计算主要遵循《中华人民共和国劳动法》的相关规定，并依据不同的工时制度有所差异。以下是对超时加班工资计算的详细解答：
一、标准工时制下的超时加班计算
在标准工时制下，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。超时加班分为以下三种情况：
工作日延长工作时间：
- 加班费标准：不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%。
- 计算公式：加班工资 = 月工资基数 ÷ 21.75 ÷ 8 × 加班小时数 × 150%。
- 例如，小张月工资5000元，某工作日加班2小时，其加班工资约为86.21元。
休息日加班：
- 加班费标准：不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%。
- 计算公式：加班工资 = 月工资基数 ÷ 21.75 × 加班天数 × 200%（或按月工资基数 ÷ 21.75 ÷ 8 × 加班小时数 × 200%计算）。
- 例如，小李月工资6000元，某周六加班一天且未安排补休，其加班工资约为551.72元。
法定休假日加班：
- 加班费标准：不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%。
- 计算公式：加班工资 = 月工资基数 ÷ 21.75 × 加班天数 × 300%（或按月工资基数 ÷ 21.75 ÷ 8 × 加班小时数 × 300%计算）。
- 例如，小王月工资4000元，国庆节加班一天，其加班工资约为551.72元。
二、综合计算工时制下的超时加班计算
在综合计算工时制下，工作时间超过法定标准工作时间的部分，视为延长工作时间，并按以下标准支付加班费：
- 加班费标准：按劳动者本人日或小时工资标准的150%支付。
- 在法定休假日安排工作的，按不低于劳动者本人日或小时工资标准的300%支付。
三、不定时工时制下的超时加班计算
在不定时工时制下，一般不执行加班工资的规定。但部分地区规定，在法定休假日工作的，用人单位也需按照不低于劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班费。
四、计算基数的确定
加班工资的计算基数应按照以下原则确定：
- 劳动合同有约定的，按约定的劳动者本人所在岗位（职位）相对应的工资标准确定。
- 无约定或约定不明的，可由用人单位与职工代表通过工资集体协商确定，并签订工资集体协议。
- 无任何约定的，统一按劳动者本人所在岗位（职位）正常出勤的月工资的70%确定，但不得低于当地最低工资标准。
五、注意事项
- 用人单位应准确记录劳动者的加班时间，并根据不同加班情形支付相应的加班费。
- 即使支付了加班费，用人单位也应遵守关于延长工作时间的法定限制，确保劳动者的休息权得到保障。
- 劳动者若发现自身加班工资未按规定支付，可通过与用人单位协商、向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁等合法途径维护自身权益。
综上所述，超时加班工资的计算是一个涉及多个因素的过程，需要用人单位和劳动者共同遵守法律规定，确保劳动者的合法权益得到充分保障。