公司12小时制上班，员工是有权拒绝加班的。下面我来详细解释一下：

首先，根据《劳动法》的相关规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这意味着，一般情况下，公司不能强制员工超出这一时间范围进行工作。

其次，如果用人单位因为生产经营工作需要，安排劳动者加班，应当与工会和劳动者协商。这意味着，加班需要双方达成一致，员工有权选择是否接受加班。如果员工选择拒绝加班，知会主管或者安排加班的管理人员即可。

再者，即使是因为特殊原因需要延长工作时间，也需要在保障劳动者身体健康的条件下进行，并且每日不得超过三小时，每月不得超过三十六小时。这一规定进一步保护了员工的合法权益，防止过度加班对员工身心健康造成损害。

综上所述，公司12小时制上班，如果要求员工超出法定工作时间进行加班，员工是有权拒绝的。如果公司在加班问题上存在违法行为，员工可以向劳动监察部门投诉，维护自己的合法权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。