可以鉴定出来。如果协议中的签字按手印和协议内容不是同一天形成的，通过专业的技术鉴定手段，比如文书鉴定，是有可能发现这一点的。

具体来说，文书鉴定是一种通过科学方法对文件上的笔迹、墨迹、印迹等进行检验分析的技术。这种技术可以分析出文件上不同部分的形成时间、书写工具、书写习惯等特征，从而判断文件是否存在篡改、伪造或不同部分非同时形成等情况。

在实际操作中，如果怀疑协议中的签字按手印和协议内容不是同一天形成的，可以委托专业的鉴定机构进行文书鉴定。鉴定机构会运用专业的设备和方法，对协议上的笔迹、手印和墨迹等进行细致的分析和比对，最终给出鉴定结论。

因此，如果协议中存在签字按手印和协议内容不同天形成的情况，通过专业的文书鉴定是有可能鉴定出来的。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。