针对你提出的“行政案件立案后，被害人不配合调查，案件到期公安机关该做出什么处理决定”的问题，以下是我的详细解答：
首先，结论上，如果行政案件立案后被害人不配合调查，且案件已经到期，公安机关在依法履行了相关调查程序后，可能会根据具体情况做出撤销案件、终止调查或者依法作出行政处罚等决定。
撤销案件：
- 在某些情况下，如果被害人的不配合导致关键证据无法收集，或者案件事实无法查清，公安机关可能会依据相关法律规定，决定撤销该行政案件。这意味着，由于证据不足或事实不清，案件将不再继续推进。
终止调查：
- 如果公安机关在调查过程中发现，案件涉及的行为可能不构成违法，或者违法行为人已经死亡、失踪等无法追究其责任的情况，公安机关可能会决定终止调查。此时，案件同样会结束，但终止调查并不意味着违法行为被忽视，而是基于实际情况做出的合理决定。
依法作出行政处罚：
- 尽管被害人不配合调查，但如果公安机关通过其他途径（如现场勘查、证人证言等）已经收集到足够证据，能够证明违法行为的存在，那么公安机关仍然可以依法对违法行为人作出行政处罚决定。这包括罚款、警告、没收违法所得等处罚措施。
在处理这类案件时，公安机关会严格遵守相关法律规定，确保程序的合法性和公正性。同时，他们也会充分考虑被害人的权益，尽可能采取多种手段和方法来收集证据，以确保案件处理的准确性和公正性。
如果你对具体案件的处理有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。