用人单位可以申请仲裁确认与劳动者的劳动合同解除。不过，这一过程需严格遵守法律法规，并确保解除行为的合法性与正当性。
可以申请仲裁解除劳动关系的情形
员工存在过错：
- 如劳动者严重违反用人单位的规章制度、严重失职或营私舞弊给用人单位造成重大损害等，用人单位有权解除劳动合同。当员工对此有异议时，用人单位可通过仲裁来确认解除的合法性。
员工无法胜任工作：
- 若劳动者不能胜任工作，且经培训或调整岗位后仍不能胜任，用人单位在履行了提前通知或额外支付工资等法定程序后，可解除劳动合同。若员工对解除有异议，同样可通过仲裁解决。
经济性裁员：
- 在用人单位因特定经济原因需要裁减人员，并满足法定条件时，可向劳动行政部门报告裁减方案并实施裁员。若裁员过程中与员工产生纠纷，也可申请仲裁。
申请仲裁的程序
提交仲裁申请：
- 用人单位需向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请，并详细列明双方基本信息、仲裁请求、事实理由、证据及来源等。
仲裁受理与审理：
- 仲裁委员会在收到申请后将进行审查，并在规定时间内决定是否受理。受理后，将安排开庭审理，双方需在庭审中充分举证、质证和辩论。
仲裁裁决：
- 仲裁庭在裁决前会尝试进行调解。若调解成功，则制作调解书；若调解不成或一方反悔，仲裁庭将及时作出裁决，以明确劳动关系的解除情况及相关责任。
注意事项与法律责任
- 在申请仲裁解除劳动关系时，用人单位必须确保解除行为的合法性和正当性，并提交充分证据支持其主张。
- 若解除行为被认定为违法或不当，用人单位可能需承担法律责任，包括支付经济补偿金等。
- 因此，在申请仲裁前，用人单位应充分评估法律风险，并咨询专业律师意见（在此情况下，即向我咨询），以确保自身权益得到有效保障。
综上所述，用人单位在符合法定条件和程序的前提下，可以申请仲裁解除与劳动者的劳动关系。但在此过程中，必须严格遵守法律法规，并确保解除行为的合法性与正当性，以避免潜在的法律风险和经济责任。