工作辞职时合同三年有效期是不影响辞职的。劳动者有解除劳动合同的权利，这是法定权利，无需单位同意。下面我详细为您解释：

1. 正常辞职规定：

   • 当劳动合同的有效期为三年时，劳动者可以正常辞职。依据《劳动合同法》的规定，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，即可解除劳动合同。如果是在试用期内，提前三天通知用人单位，就能解除劳动合同。

2. 特别约定检查：

   • 在决定辞职前，劳动者需要仔细查看合同中是否有特别限制辞职的条款。如果合同中存在违法或者明显不公平的相关约定，这类约定的效力可能会受到影响，劳动者可以依法主张其无效。

3. 单位违约情况：

   • 如果用人单位存在未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件、未及时足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等情形，劳动者可以即时解除劳动合同，无需事先告知用人单位。

4. 纠纷处理：

   • 若辞职过程中引发了纠纷，例如用人单位以劳动者辞职导致其遭受损失为由要求劳动者进行赔偿，用人单位必须提供证据证明该损失和劳动者辞职之间存在因果关系，并且要明确具体的损失数额等。若无法提供有效证据，其赔偿主张很难获得支持。

综上所述，即使劳动合同有效期为三年，劳动者仍然有权利依法辞职。只要按照法定程序进行，就不会产生不必要的法律纠纷。如果您在辞职过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。