企业自己查出来的食品过期不能直接作为行政处罚的依据。下面我来详细解释一下这个问题：
法规依据
根据《中华人民共和国行政处罚法》以及相关食品安全法律法规的规定，行政处罚的依据应当是由具有行政执法权的机关，在依法履行监督检查职责过程中，发现并查实的违法行为。这意味着，行政处罚的依据必须是由执法机关通过合法的程序和手段获取的证据，而不能是企业自行发现并上报的问题。
逻辑分析
执法主体：行政处罚的主体是具有行政执法权的机关，如市场监管部门、食品药品监管部门等。企业并不具备行政执法权，因此其自行发现的问题不能直接作为行政处罚的依据。
证据来源：行政处罚所依据的证据应当是执法机关在依法履行监督检查职责过程中获取的。企业自行检查并上报的过期食品信息，虽然可能反映了企业内部的食品安全问题，但并不能直接作为执法机关进行行政处罚的证据。
法律程序：行政处罚需要遵循严格的法律程序，包括立案、调查取证、告知、听证、作出处罚决定等。企业自行发现的问题，即使真实存在，也需要经过执法机关的进一步调查和确认，才能作为行政处罚的依据。
实际操作建议
企业自查自纠：企业应当建立健全食品安全自查制度，定期或不定期地对自身的食品安全状况进行检查。如果发现过期食品等问题，应当立即进行整改，并加强内部管理，防止类似问题再次发生。
主动报告：虽然企业自行发现的问题不能直接作为行政处罚的依据，但企业仍然有义务向执法机关报告已知的食品安全问题。这有助于执法机关及时了解和掌握食品安全状况，并采取必要的监管措施。
配合调查：如果执法机关对企业进行食品安全检查或调查，企业应当积极配合，提供必要的资料和协助。这有助于执法机关更快地查明事实，作出准确的行政处罚决定。
综上所述，企业自己查出来的食品过期不能直接作为行政处罚的依据。但企业应当加强自查自纠，主动报告已知的食品安全问题，并配合执法机关的调查工作。