若农民工工资已经支付给实际施工人，应确认该支付是否有效，并确保农民工真正获得工资，否则需承担相应法律责任。针对此问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

1. 支付有效性的确认：

   • 根据《保障农民工工资支付条例》的相关规定，用人单位应当将工资直接支付给农民工本人，而不得通过不具备用工主体资格的组织或者个人（如实际施工人）转发。因此，首先需要确认支付给实际施工人的工资是否真正到了农民工手中。
   • 如果实际施工人并未将工资转发给农民工，或者存在克扣、拖欠等情况，那么该支付是无效的。

2. 法律责任：

   • 如果用人单位未按规定支付农民工工资，根据《保障农民工工资支付条例》，将面临责令限期支付、逾期不支付加付赔偿金等法律责任。
   • 同时，如果用人单位以支付给实际施工人为由拒绝支付农民工工资，这将不能成为其免责的理由。用人单位仍需承担支付农民工工资的责任。

3. 后续措施：

   • 核实工资支付情况：建议用人单位立即核实农民工是否真正收到了工资，如果未收到，应尽快补发。
   • 规范支付流程：为避免类似情况再次发生，用人单位应规范工资支付流程，确保工资直接支付给农民工本人。
   • 法律救济途径：如果农民工因未收到工资而提起诉讼，用人单位应积极应诉，并根据法院判决承担相应的责任。

综上所述，即使农民工工资已经支付给实际施工人，用人单位仍需确保农民工真正获得了工资。如果农民工未收到工资，用人单位应承担相应的法律责任，并尽快采取措施补发工资、规范支付流程。如有进一步需要，您可以继续咨询我。