核心结论：实际施工人在面对发包人未付款且其中包含农民工工资的情况时，可以通过以下途径来维护自身及农民工的合法权益。
与发包人协商：
- 实际施工人首先可以尝试与发包人进行友好协商，明确指出未付款项中包含农民工工资这一特殊情况，强调农民工工资的支付紧迫性和重要性，争取发包人尽快支付相应款项。
- 在协商过程中，可以提出合理的付款计划或分期付款方案，以减轻发包人的资金压力，同时确保农民工工资能够得到及时支付。
依据合同条款主张权利：
- 如果实际施工人与发包人之间签订了施工合同，并且合同中明确规定了付款条款和违约责任，实际施工人可以依据合同条款向发包人主张权利。
- 可以通过发送律师函或提起诉讼等方式，要求发包人按照合同约定支付款项，并承担因违约造成的损失，包括农民工工资的支付责任。
利用法律保障农民工工资支付：
- 根据相关法律法规，如《保障农民工工资支付条例》等，农民工工资应当得到优先保障。实际施工人可以积极向相关部门（如劳动监察部门、建设主管部门等）反映情况，寻求政府部门的帮助和支持。
- 政府部门有权对发包人进行监管和处罚，并可以采取措施确保农民工工资得到支付，如责令发包人限期支付、将发包人列入失信联合惩戒对象名单等。
考虑实际施工人的垫付责任与追偿权：
- 在某些情况下，为了保障农民工的合法权益，实际施工人可能需要先行垫付农民工工资。但垫付后，实际施工人有权向发包人追偿垫付的款项。
- 实际施工人应当保留好垫付工资的相关证据（如工资单、转账记录等），以便在后续追偿过程中证明自己的垫付行为和金额。
寻求法律援助或诉讼途径：
- 如果协商和行政手段均无法解决问题，实际施工人可以考虑通过法律援助或诉讼途径来维护自己的权益。
- 可以聘请专业律师代理案件，向法院提起诉讼，要求发包人支付未付款项及承担相应法律责任。在诉讼过程中，要充分准备证据材料，证明发包人的违约行为和自己的损失情况。
额外建议：
- 在处理此类问题时，实际施工人应当保持冷静和理性，避免采取过激行为或违法手段来维护权益。
- 应当加强与农民工的沟通和协调，及时告知他们处理进展和结果，以维护社会稳定和和谐劳动关系。
在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同，因此建议实际施工人在遇到此类问题时，及时向我咨询，以便根据具体情况制定合适的应对策略。