农民工在工地骨折后，工资发放的问题，主要取决于农民工与谁建立了劳动关系。下面我将分情况详细解答：
如果农民工与建筑公司建立了劳动关系：
- 在这种情况下，农民工的工资应由建筑公司发放。因为根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按时足额支付劳动者的工资。如果农民工在工地受伤，且被认定为工伤，那么在停工留薪期内，建筑公司仍应按照原工资标准支付农民工的工资。
如果农民工与包工头建立了雇佣关系，而包工头又不具备用工主体资格：
- 这种情况下，虽然农民工是直接受包工头雇佣的，但由于包工头不具备用工主体资格，因此农民工与建筑公司之间可能形成事实劳动关系。在这种情况下，农民工的工资也应由建筑公司发放，而不是由包工头发放。如果农民工受伤被认定为工伤，建筑公司同样应承担支付工资的责任。
特殊情况的考虑：
- 如果农民工与包工头之间签订了明确的劳务合同，且合同中约定了工资支付方式和责任主体，那么应根据合同的约定来确定工资发放的主体。但需要注意的是，这种约定不能违反法律法规的强制性规定。
综上所述，农民工在工地骨折后，工资发放的主体主要取决于其与谁建立了劳动关系。如果与建筑公司建立了劳动关系，那么工资应由建筑公司发放；如果与包工头建立了雇佣关系，但包工头不具备用工主体资格，那么工资也应由建筑公司发放。在任何情况下，农民工都应确保自己的合法权益得到保障，如果遇到工资拖欠或拒付的情况，应及时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。