农民工工资的发放主体需根据具体情况判断，主要分为以下两种情形：

1. 劳务公司直接发放
   若农民工与劳务公司签订劳动合同或形成事实劳动关系，则工资应由劳务公司直接支付。此时劳务公司作为用人单位，需承担工资支付义务，包括按月足额发放、提供工资清单等。总包单位若已将工程款（含人工费）足额支付给劳务公司，则无需重复支付工资，但需监督劳务公司按时发放。

2. 总包单位代发（特殊情形）
   根据《保障农民工工资支付条例》第三十一条，若存在以下情形，总包单位需直接代发工资：

   • 分包单位（劳务公司）拖欠工资；
     
   • 总包单位未将人工费拨付至农民工工资专用账户；
     
   • 劳务公司未开设工资专用账户或未委托总包单位代发。
     此时总包单位需从应付工程款中划拨资金，通过专用账户直接支付给农民工，并留存相关凭证。

关键风险提示：

• 无论何种模式，总包单位均需承担“总包责任”，即对工资支付负有监督义务。若因监督不力导致拖欠，可能面临行政处罚或连带赔偿责任。
  
• 农民工应保留劳动合同、考勤记录、工资条等证据，以便在纠纷中主张权利。
  

如有具体案件细节（如合同签订主体、工资发放记录等），可进一步向我咨询，我会结合证据分析责任主体。