首先，我们需要明确的是，党委任免二线干部并明确保留正股待遇，这是党内管理的事务，通常受党内相关法规和政策的调整。而单位按副股级待遇执行，则涉及到单位内部的人事管理和待遇问题，这主要受《劳动法》、《劳动合同法》以及单位内部规章制度等法律法规的约束。
针对您提出的问题，我们可以从以下几个角度进行分析：
党内法规与政策角度：
- 党委对干部的任免和待遇有明确的规定，如果党委已经明确保留某干部的正股待遇，那么单位在未经党委同意或未出现法定事由的情况下，擅自降低该干部的待遇，可能违反了党内的相关规定。
劳动法律法规角度：
- 根据《劳动法》和《劳动合同法》，员工与单位之间建立劳动关系，应当签订劳动合同，并在合同中明确约定工作内容、工作地点、劳动报酬等条款。如果单位单方面降低员工的待遇，且未能与员工达成一致，可能构成对劳动合同的违约。
- 此外，单位内部的规章制度也应当遵循法律法规的规定，不能违反劳动法律法规的基本原则。如果单位规章制度中规定了与法律法规相悖的内容，该内容将无效。
实际执行与救济途径：
- 如果单位确实按副股级待遇执行了，而该干部认为自己的权益受到了侵害，可以通过与单位协商、向工会反映、提起劳动仲裁或诉讼等方式来维护自己的合法权益。
- 在此过程中，该干部可以主张单位违反了党内规定和劳动法律法规，要求单位恢复其正股待遇或承担相应的法律责任。
综上所述，单位按副股级待遇执行是否合法，需要具体分析党内规定、劳动法律法规以及单位内部规章制度的内容和执行情况。如果该干部认为自己的权益受到了侵害，建议及时与单位沟通并寻求法律救济途径。如果您需要更详细的法律咨询或帮助，请随时向我提问。