学校食堂使用超保质期食品原料，将被责令整改、罚款，并没收超过保质期的食品原料。具体分析如下：

一. 法律依据明确

• 根据《中华人民共和国食品安全法》的相关规定，食品经营者应当按照保证食品安全的要求贮存食品，定期检查库存食品，及时清理变质或者超过保质期的食品。若违反此规定，将受到相应的行政处罚。

二. 具体处罚措施

• 责令整改：监管部门会要求学校食堂立即停止使用超过保质期的食品原料，并进行整改，以确保食品安全。
• 罚款：根据违法行为的严重程度，监管部门会对学校食堂处以相应的罚款。
• 没收超过保质期的食品原料：为防止这些原料继续流入食品生产或消费环节，监管部门会依法没收这些超过保质期的食品原料。

三. 实际案例

• 以普宁市某学校为例，该校食堂因使用已过保质期的“蒸肉米粉五香味”和“普宁豆酱”，被普宁市市场监督管理局依法作出了责令整改、罚款、没收超过保质期食品原料的行政处罚。

综上所述，学校食堂使用超保质期食品原料是违法行为，将受到法律的制裁。我建议学校食堂应严格遵守食品安全法规，定期检查库存食品，及时清理变质或超过保质期的食品，以确保学生的饮食安全。如有进一步需要，您可以继续咨询我。