工业厂房做办公室是否合法，取决于是否改变了土地用途以及是否获得了相关部门的批准。
未改变土地用途的情况：
- 如果工业厂房本身在设计时就包含了办公区域，或者厂房所在地块的土地使用证上明确允许包含办公用途，那么在这种情况下，将工业厂房的部分区域用作办公室是合法的。
改变土地用途的情况：
- 根据《土地管理法》的相关规定，建设单位使用国有土地时，需按照土地使用权出让合同或划拨批准文件的规定使用土地。若需改变土地用途（如将工业用地改为商业或办公用途），必须经过相关政府自然资源主管部门的同意，并报原批准用地的人民政府批准。
- 因此，如果工业厂房原本的土地用途仅为工业生产，而现计划将其部分或全部改为办公室，那么就需要先向当地规划部门申请变更土地使用性质，获得批准后还需进行房屋所有权变更登记。只有在完成了这些法定程序后，将工业厂房用作办公室才是合法的。
特定情况下的过渡政策：
- 根据国家有关产业用地政策，对于利用闲置厂房，兴办文化创意、科技研发、健康养老、工业旅游、众创空间、生产性服务业、互联网+等新产业新业态的，可实行继续按原用途和土地权利类型使用土地的过渡政策，过渡期为5年。
- 在这种特定情况下，如果工业厂房的改造符合上述新产业新业态的要求，那么在过渡期内，可能无需立即变更土地使用性质，即可将厂房用作办公室。但具体是否适用该政策，还需咨询当地相关部门以获取准确信息。
综上所述，工业厂房做办公室是否合法，需要根据具体情况来判断。如果涉及改变土地用途，务必先咨询当地相关部门并办理相关手续，以确保改造行为的合法性。