在工厂患有慢性阻塞性肺病，若该疾病被认定为工伤，则有权获得相应的工伤赔偿。具体分析如下：

一. 工伤认定

1. 依据《工伤保险条例》，若慢性阻塞性肺病是因工作引发或在工作中加重，可视为工伤。例如，长期吸入工作环境中的有害物质导致发病或病情加重，即符合工伤认定条件。
2. 申请流程：

    - 首先，需收集医疗证明和工作相关证据，证明疾病与工作之间的因果关系。
    - 接着，向单位提交工伤认定申请。
    - 如单位拒绝认定，可向劳动仲裁机构申请仲裁。
    - 对仲裁结果不满，还可向法院提起诉讼。
   

二. 赔偿处理

1. 赔偿内容：一旦工伤被认定，员工有权享受包括医疗费、康复费、停工留薪期间的工资福利、一次性伤残补助金等在内的工伤赔偿。
2. 操作建议：

    - 确保每一步骤都准备充分且证据确凿，以维护自身权益。
    - 如遇单位不配合或拒绝赔偿，应及时寻求劳动仲裁或法律途径解决。
   

我建议，您首先收集好所有相关证据，特别是医疗证明和与工作相关的证据，然后按照上述流程向单位提出工伤认定申请。如单位不认可，可依次向劳动仲裁机构和法院寻求帮助。如有进一步需要，您可以继续咨询我。