如果员工使用假毕业证入职，且这一行为被用人单位发现，用人单位是有权辞退该员工的。以下是对此问题的详细解答：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国劳动合同法》相关规定：

   • 第二十六条：以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的，劳动合同无效或者部分无效。
   • 第三十九条：劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：……（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的……

2. 人力资源社会保障部最高人民法院《关于劳动人事争议仲裁与诉讼衔接有关问题的意见(一)》相关规定：

   • 第十九条：用人单位因劳动者违反诚信原则，提供虚假学历证书、个人履历等与订立劳动合同直接相关的基本情况构成欺诈解除劳动合同，劳动者主张解除劳动合同经济补偿或者赔偿金的，劳动人事争议仲裁委员会、人民法院不予支持。

二、用人单位辞退员工的具体条件与程序

1. 明确证据：用人单位需要能够证明员工在入职时提供了虚假的学历证书，且这一学历是用人单位在招聘时有明确要求的。

2. 及时处理：如果用人单位在员工入职后发现学历造假，应及时处理。若未及时处理，此后再以员工提供虚假学历为由解除劳动关系的，则可能属于违法解除，需要支付赔偿金。

3. 无需支付经济补偿金或赔偿金：在符合上述条件的情况下，用人单位可以依法解除劳动合同，且无需支付经济补偿金或赔偿金。

三、学历造假的其他后果

1. 行政责任和民事责任：虽然购买和使用假文凭目前尚不构成刑事责任，但需要追究相应的行政责任和民事责任。

2. 不良征信记录：随着国家征信系统的建立，使用假学历将终身记入征信档案。

3. 影响个人职业发展和社会声誉：学历造假不仅会影响个人的职业发展，还可能对个人的社会声誉造成负面影响。

4. 对子女产生间接影响：如果父母的学历存在造假行为，可能会影响到子女的政审结果，如报考公务员、事业单位编或者当兵等。

综上所述，使用假毕业证入职是违法的，一旦被发现，用人单位有权辞退该员工，并且员工还可能面临其他严重的后果。因此，建议求职者应诚实守信，提供真实的学历信息。