合同中明确约定违约不退还保证金，这一条款的合法性需视具体情况而定。

1. 合同条款的合法性：

   • 如果该条款是双方真实意思表示，且不违反法律法规的强制性规定，通常具有法律效力。
   • 但如果约定的不退保证金条款存在显失公平、免除一方主要责任或排除对方主要权利等情形，可能会被认定为无效。例如，在某些消费合同中，商家单方面约定保证金不退，这种情况下该条款可能会被认定无效。

2. 违约后的法律责任：

   • 如果合同中有明确约定，且该约定合法有效，那么当一方违约时，另一方有权根据合同条款要求不退还保证金。
   • 但如果违约方认为该条款不公平或不合理，可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等合法途径来维护自己的权益。

3. 实际操作的建议：

   • 在签订合同时，双方应充分协商并明确保证金的相关条款，包括保证金的金额、用途、退还条件等。
   • 如果遇到保证金不退还的情况，建议先通过协商或调解来解决争议。如果无法达成一致，可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。

综上所述，合同中明确约定违约不退还保证金的条款，其合法性需根据具体情况来判断。如果双方对该条款有争议，建议通过法律途径来寻求妥当的解决方案。如果你在这方面有进一步的法律问题或需要更详细的解释，可以直接向我咨询。