在食堂上班得了甲肝不能上班，一般情况下在医疗期内是有工资的。具体分析如下：

首先，根据《中华人民共和国劳动法》和相关规定，员工因病或者非因工负伤需要停止工作进行治疗的，根据员工实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。在这个医疗期内，用人单位应当支付员工病假工资或者疾病救济费，具体标准由各省、自治区、直辖市规定，但通常不得低于当地最低工资标准的80%。

其次，对于你提到的甲肝情况，这属于一种疾病，且通常具有一定的传染性。因此，在患病期间，为了你和同事的健康，确实需要暂停工作进行治疗和休养。在这个期间，你应当享受上述提到的医疗期和病假工资或疾病救济费。

最后，我建议你尽快与用人单位沟通，明确你的医疗期和病假工资或疾病救济费的具体安排。同时，也要关注自己的健康状况，积极配合治疗，争取早日康复回到工作岗位。

综上所述，你在食堂上班得了甲肝不能上班时，在医疗期内是有工资的。具体工资标准需参照当地的相关规定执行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。