结论前置：员工不满勤按照出勤天数发工资，在大多数情况下是合法的，但需严格遵守相关法律法规，并综合考虑多种因素，以确保劳动者的合法权益不受侵害。
合法性依据与合理性分析
法律规定：
- 根据《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》，月计薪天数为21.75天，用人单位可以此为基础，结合员工实际出勤天数来计算工资，这符合劳动法律法规的基本要求。
- 《中华人民共和国劳动法》第四十七条也明确赋予用人单位依法自主确定本单位工资分配方式和工资水平的权利。
劳动付出与报酬对应：
- 工资与实际工作天数挂钩，体现了按劳分配的原则，符合公平公正的价值理念。员工实际出勤多少天，就获得相应天数的工资，这是合理且合法的。
实施条件与注意事项
不低于最低工资标准：
- 即便按实际出勤天数计算工资，用人单位支付劳动者的工资也不得低于当地最低工资标准。这是保障劳动者基本生活需求的重要法律底线。
- 计算公式：若员工月工资低于当地最低工资标准，则应按照最低工资标准发放。例如，当地最低工资标准为2000元/月，员工实际出勤工资计算为1800元，则应按2000元发放。
及时足额支付：
- 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或无故拖欠。这是《中华人民共和国劳动法》第五十条的明确规定，用人单位必须严格遵守。
加班费的计算：
- 对于加班情况，用人单位必须严格按照法律规定支付加班费。平时延时加班、周末加班以及法定节假日加班，都有不同的计算方式，用人单位不得忽视或混淆。
- 计算公式示例：
- 平时延时加班费：日工资×150%×加班小时数
- 周末加班费：日工资×200%×加班天数（或小时数，如按小时计算则需先算出日工资对应的小时工资）
- 法定节假日加班费：日工资×300%×加班天数
带薪假期的处理：
- 员工依法享有的带薪年假、病假（在规定医疗期内）、婚假、产假、陪产假等带薪假期，用人单位应视为正常出勤并支付工资。这些假期是劳动者的合法权益，用人单位不得因这些假期而扣除工资。
劳动合同约定：
- 若劳动合同中明确约定了工资计算方式并非按实际出勤天数，而是固定月薪等其他形式，用人单位应严格按照合同约定执行。否则，将构成违约行为，劳动者有权依法维护自己的权益。
特殊情况的处理
入职不满一个月：
- 对于入职不满一个月的员工，工资应按实际出勤天数计算。即日工资×出勤天数，其中日工资基于约定的月薪和月计薪天数确定。
灵活调整与透明沟通：
- 考虑到每月天数不固定及法定节假日等因素，用人单位应灵活调整工资计算方式，以确保准确性和合理性。同时，公司应公开工资计算方式，员工有权对计算方式提出异议，并通过协商或投诉维护自己的权益。
总结与建议：员工不满勤按照出勤天数发工资，在遵守相关法律法规和劳动合同约定的前提下，是合法且合理的。但用人单位在实施过程中，需特别注意不低于最低工资标准、及时足额支付、加班费计算、带薪假期处理以及劳动合同约定等关键点。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将竭诚为你服务。