农业设施用地建厂房是否算违建，关键在于是否依法办理了相关审批手续，并符合土地用途规划。 以下是对此问题的详细分析：
一、合法建设的情况
已办理审批手续：
- 若在农业设施用地上建设厂房，已经依法办理了农用地转建设用地审批手续，并且符合当地土地利用总体规划和城乡规划要求，则该厂房不属于违建。
- 审批流程通常包括向当地自然资源和规划部门以及农业农村部门提交申请，明确建设的用途、规模、选址等详情，并经过审核确认符合相关政策法规要求后获得用地批准。
符合设施农业用地规定：
- 根据相关规定，若建房作为农业生产必要的配套设施（如农产品分拣、晾晒、保鲜存储的简易房屋，农资农机具存放、维修场所等），并依法办理了设施农业用地备案等手续，则不属于违建。
- 此类建设需在规定的用地规模和建设标准内进行，且直接服务于农业生产。
二、违法建设的情况
擅自改变土地用途：
- 农业设施用地是专为农业生产设立的特殊用地类型，若未经批准擅自将其用于建设与农业生产无关的厂房（如工业厂房、商业用房等），则属于擅自改变土地用途，构成违建。
未办理或不全审批手续：
- 即使厂房建设初衷与农业生产相关，但若未按规定办理用地审批及建设许可手续（包括但不限于农用地转用审批、建设工程规划许可证等），同样会被认定为违建。
超出规定面积和标准：
- 即使办理了相关手续，若建设的厂房超出了规定的用地规模和建设标准，超出部分仍可能被认定为违建。
三、需要办理的手续
若要在农业设施用地上合法建设厂房，通常需要办理以下手续：
申请与审批：
- 向当地自然资源和规划部门以及农业农村部门提交建设申请，明确建设的用途、规模、选址等详情。
- 相关部门将审核申请内容，确认其是否符合土地利用总体规划、畜牧业发展规划等政策法规要求。
办理用地与建设手续：
- 涉及农用地转用的，需依法办理农用地转用审批手续。
- 使用集体土地的，还需与农村集体经济组织签订用地协议。
- 根据地方规定，办理建设工程规划许可证、施工许可证等必要的建设许可手续。
合规建设：
- 在确保所有审批文件齐全且有效后，方可按照批准内容进行建设。
四、法律后果与建议
- 法律后果：一旦被认定为违建，将面临责令限期拆除、罚款甚至更严厉的行政处罚。
- 建议：为避免法律风险和经济损失，建议在农业设施用地上进行任何建设活动前，务必深入了解并严格遵守相关法律法规及审批程序。如有疑问或不确定之处，可以直接向我咨询，以获取准确指导。
综上所述，农业设施用地建厂房是否构成违建，关键在于是否依法办理了相关审批手续并符合土地用途规划。为确保建设项目的合法性，请务必在建设前充分准备并确保所有手续完备。