针对您提出的“停工令下了以后，施工单位还继续施工”的问题，核心结论是：您可以通过行政投诉、法律诉讼或向相关部门申请强制执行等途径来制止施工单位的违法行为，并维护自身合法权益。以下是对此问题的详细分析：
行政投诉途径：
- 向环保部门或建设主管部门投诉：停工令通常由环保部门或建设主管部门根据环境保护、安全生产等法律法规发出。若施工单位违反停工令继续施工，您可以直接向这些部门投诉，要求他们依法对施工单位进行处罚，并责令其立即停工。
- 投诉时需提供证据：为了更有效地推动投诉处理，建议您在投诉时提供相关证据，如停工令的文件、施工单位继续施工的照片或视频等，以证明施工单位的违法行为。
法律诉讼途径：
- 提起民事诉讼：如果施工单位的继续施工行为给您造成了损失（如噪音污染、环境污染等），您可以依据相关法律法规，向法院提起民事诉讼，要求施工单位承担赔偿责任。
- 申请诉前禁令：在提起诉讼前，您还可以考虑向法院申请诉前禁令，要求法院裁定施工单位立即停止施工，以防止损失进一步扩大。
向相关部门申请强制执行：
- 若停工令具有强制执行力：如果停工令是由法院或其他具有强制执行权的机关发出的，且施工单位拒不执行，您可以向这些机关申请强制执行，要求他们依法采取强制措施，迫使施工单位停工。
额外建议：
- 保持冷静，依法维权：在处理此类问题时，建议您保持冷静，不要采取过激行为。依法维权是保护自身权益的最有效途径。
- 咨询专业人士：虽然我可以为您提供法律方面的建议，但每个案件的具体情况都有所不同。如果您在处理过程中遇到复杂问题，建议咨询具有相关经验的律师或法律专家，以获取更具体的指导。
行动指南：
- 收集并保存好停工令的文件、施工单位继续施工的证据等关键材料。
- 根据实际情况，选择向环保部门、建设主管部门投诉，或向法院提起诉讼、申请诉前禁令等途径来维护自身权益。
- 在处理过程中，保持与相关部门的沟通，及时了解处理进展，并根据需要调整维权策略。