当工地发生安全事故，质监站下发停工令后，如果甲方仍然要求继续施工，监理单位应采取以下措施来妥善处理这一复杂情况：
一、明确责任与立场
理解停工令的法律效力：
- 停工令是由质监站根据相关法律法规和安全标准下发的，具有法律约束力。
- 监理单位应充分认识到停工令的严肃性和重要性，不得擅自违反。
明确监理职责：
- 监理单位作为工程建设的监督方，有责任确保施工活动符合法律法规和安全标准。
- 在停工令生效期间，监理单位应坚决制止任何违规施工行为。
二、与甲方沟通
解释停工令的原因和后果：
- 向甲方详细说明安全事故的具体情况、停工令的法律依据以及继续施工可能带来的风险。
- 强调违反停工令可能导致的法律后果，包括行政处罚、工程延期、质量隐患等。
提出合理建议：
- 建议甲方尊重停工令的决定，积极配合质监站和监理单位的工作。
- 提出可行的解决方案，如整改安全隐患、加强安全管理等，以尽快恢复施工。
三、协调与处理
与质监站保持密切联系：
- 及时向质监站报告甲方的要求以及监理单位的应对措施。
- 寻求质监站的专业指导和支持，确保处理方案的合法性和有效性。
组织安全评估与整改：
- 协助甲方进行安全评估，找出安全隐患的具体位置和原因。
- 监督甲方按照评估结果进行整改，确保整改措施得到有效落实。
考虑法律途径：
- 如果甲方坚持违规施工，监理单位应考虑通过法律途径维护自身权益和工程安全。
- 可以咨询专业律师，了解相关法律规定和维权方式。
四、总结与反思
总结经验教训：
- 对此次安全事故和停工令的处理过程进行总结，分析存在的问题和不足。
- 提出改进措施，加强监理工作的规范性和有效性。
加强安全管理：
- 监理单位应加强对施工过程中的安全监督和管理，确保施工活动始终符合法律法规和安全标准。
- 提高监理人员的安全意识和专业素养，提升监理工作的整体水平。
综上所述，当工地发生安全事故且质监站下发停工令后，监理单位应坚守职责、积极沟通、协调处理，并总结经验教训以加强安全管理。这样才能有效应对甲方的违规施工要求，确保工程建设的顺利进行和工程质量的安全可靠。