结论：不参加晨会，公司一般不可以直接扣员工工资，但具体情况需结合公司规章制度、劳动合同以及相关法律法规来综合判断。
分析说明：
公司规章制度与劳动合同：
- 公司规章制度和劳动合同是确定员工权利和义务的重要依据。如果公司规章制度或劳动合同中明确规定了晨会为必须参加的活动，并且规定了未参加的处罚措施（如扣工资），那么员工未参加晨会可能面临相应的处罚。但即便如此，这种处罚也必须合法合理，不能违反法律法规的强制性规定。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。同时，该法第三十九条也规定了用人单位可以解除劳动合同的情形，但并未直接规定未参加晨会可以扣工资。
工资扣除的合法性：
- 工资是员工劳动的报酬，公司不能随意扣除。根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 如果公司想要扣除员工工资，必须基于合法、合理的理由，并且需要符合相关法律法规的规定。例如，员工因故意或重大过失给公司造成损失，公司可以按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
晨会的性质与工资扣除的关系：
- 晨会通常被视为公司内部管理的一种方式，用于传达信息、安排工作等。如果晨会并非员工必须参加的工作活动，或者公司没有在规章制度或劳动合同中明确规定未参加晨会的处罚措施，那么公司不能因为员工未参加晨会而扣除其工资。
特殊场景：
- 如果公司规章制度或劳动合同中明确规定了晨会为必须参加的活动，并且规定了合理的处罚措施（如警告、罚款等，但罚款金额需合法合理），同时这种规定不违反法律法规的强制性规定，那么员工未参加晨会可能面临相应的处罚。但即便如此，公司也不能直接扣除员工的工资作为处罚，除非这种扣除符合上述提到的合法、合理的条件。
建议与行动：
- 对于员工：如果公司因为未参加晨会而扣除你的工资，你可以先查看公司规章制度和劳动合同中是否有相关规定。如果没有相关规定或者规定不合法合理，你可以与公司协商要求恢复工资或者向劳动监察部门投诉。
- 对于公司：建议公司在制定规章制度和劳动合同时明确晨会的性质、参加要求以及未参加的处罚措施（如果确实需要处罚的话），并且确保这些规定合法合理、不违反法律法规的强制性规定。同时，公司也应该通过合理的方式鼓励员工参加晨会，而不是简单地采取扣工资等处罚措施。
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