针对新入职员工得过癌症这一情况，在签订相关协议时，我们主要需要关注的是医疗期的确定以及可能的岗位调整问题。以下是一些建议，供您参考：
一、医疗期的确定
了解当地规定：
- 首先，需要了解当地对于患有癌症等特殊疾病职工的医疗期规定。不同地区可能有不同的执行标准，有的地区可能规定医疗期为24个月，而有的地区则可能根据员工实际参加工作年限和在本单位工作年限来确定医疗期。
参考主流观点：
- 在没有明确规定的地区，可以参考主流观点，即医疗期还是应当根据员工实际参加工作年限和在本单位工作年限确定。如果医疗期满后尚不能痊愈，可以申请延长医疗期。
明确协议内容：
- 在签订劳动合同时，可以明确约定医疗期的具体时长，以及医疗期满后的处理方式（如是否延长、延长条件等）。同时，也可以约定在医疗期内员工的工资待遇、福利保障等事项。
二、岗位调整问题
依法调岗：
- 如果员工在医疗期满后不能从事原来的工作岗位，用人单位有权根据法律规定进行调岗。但调岗必须合法、合理，不能侵犯员工的合法权益。
协商调岗：
- 在调岗前，建议与员工进行充分沟通，协商确定新的工作岗位和职责。双方协商一致后，应形成书面文件并变更劳动合同。
约定调岗条款：
- 在劳动合同中，可以预先约定调岗的相关条款，如调岗的条件、程序、新岗位的工资待遇等。但这些条款必须合法、合理，且不得损害员工的利益。
三、协议签订建议
全面评估员工状况：
- 在签订协议前，应对员工的身体状况、工作能力等进行全面评估，确保协议内容符合员工的实际情况和用人单位的需求。
明确双方权利和义务：
- 协议中应明确双方的权利和义务，包括医疗期的时长、工资待遇、岗位调整、保密义务、违约责任等。
寻求法律意见：
- 在签订协议前，建议咨询专业律师或法律顾问的意见，确保协议内容合法、有效，且能够保护用人单位和员工的合法权益。
保持沟通：
- 在协议执行过程中，应保持与员工的良好沟通，及时了解员工的身体状况和工作情况，以便根据实际情况进行调整和处理。
综上所述，针对新入职员工得过癌症的情况，在签订协议时需要重点关注医疗期的确定和岗位调整问题。通过全面评估员工状况、明确双方权利和义务、寻求法律意见以及保持沟通等措施，可以确保协议内容合法、有效，且能够保护用人单位和员工的合法权益。