结论：公司“上三休四”的工作安排以及只支付三天工资的做法是否合法，需根据具体情况判断，包括劳动合同的约定、公司规章制度以及相关法律法规的规定。

分析如下：

1. 劳动合同与规章制度：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同应当明确约定工作内容、工作地点、工作时间和休息休假等条款。如果劳动合同中明确规定了“上三休四”的工作安排，并且这一安排不违反法律法规的强制性规定，那么这种工作安排在合同层面是合法的。
   • 同时，公司规章制度也是判断工作安排合法性的重要依据。如果公司规章制度中明确规定了“上三休四”的工作模式，并且该规章制度已经经过民主程序制定、公示或告知劳动者，那么这种工作安排在公司内部也是合法的。

2. 工资支付：

   • 关于工资支付，根据《中华人民共和国劳动法》的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。如果公司按照“上三休四”的工作安排，只支付了三天的工资，而劳动者实际上在这四天休息期间并未获得应得的工资（如带薪年休假、调休等），那么公司的做法可能构成违法。
   • 具体来说，如果劳动者在休息日（如周末或调休日）工作，公司应当支付加班费；如果劳动者在法定节假日工作，公司应当支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。如果公司未按照这些规定支付工资，那么劳动者的权益就受到了侵害。

3. 综合判断：

   • 如果“上三休四”的工作安排是劳动合同或公司规章制度中明确规定的，并且公司按照这一安排合理支付了劳动者的工资（包括加班费等），那么这种做法是合法的。
   • 如果“上三休四”的工作安排未经劳动合同或公司规章制度明确规定，或者公司未按照这一安排合理支付劳动者的工资，那么这种做法可能构成违法，劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

建议：

• 对于劳动者来说，如果对公司的工作安排或工资支付有疑问，应当首先查阅劳动合同和公司规章制度，了解自己的权益和义务。
• 如果发现公司的做法可能违法，劳动者可以与公司进行协商，要求公司按照法律法规的规定支付工资或调整工作安排。
• 如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果公司的做法被认定为违法，公司可能需要承担补发工资、支付加班费、赔偿损失等法律责任。
• 同时，公司还可能面临劳动监察部门的处罚和声誉损失等后果。

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