结论：工作4天只发3天工资是否合法，需根据具体情况判断，包括是否签订劳动合同、是否存在扣款合法事由等。以下从不同角度进行分析：

一、劳动合同签订情况

1. 已签订劳动合同：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。若劳动合同中明确约定了工资支付方式和标准，且没有合法事由（如劳动者违反公司规章制度造成损失等）进行扣款，那么用人单位工作4天只发3天工资的行为是违法的。

2. 未签订劳动合同：

   • 即使未签订劳动合同，劳动者与用人单位之间仍存在事实劳动关系。根据《中华人民共和国劳动法》的规定，用人单位应当按照不低于当地最低工资标准的水平支付劳动者工资。若用人单位无故克扣工资，同样构成违法。

二、扣款合法事由

1. 存在合法扣款事由：

   • 如果劳动者存在违反公司规章制度、造成用人单位经济损失等情形，用人单位可以根据相关规定或劳动合同约定进行扣款。但扣款金额应当合理，且不得超过劳动者当月工资的20%，同时扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。若用人单位扣款符合这些条件，那么工作4天只发3天工资（假设其中1天工资为合法扣款）可能是合法的。

2. 不存在合法扣款事由：

   • 若用人单位无法提供合法扣款事由，或者扣款金额不合理、超过法定限制，那么工作4天只发3天工资的行为就是违法的。

三、法律建议

1. 与用人单位协商：

   • 劳动者可以先与用人单位进行沟通，了解扣款的具体原因和依据，并尝试协商解决。

2. 向劳动监察部门投诉：

   • 如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，要求用人单位支付被克扣的工资。

3. 申请劳动仲裁：

   • 若投诉后问题仍未得到解决，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

四、可能法律后果

1. 用人单位需支付被克扣工资：

   • 如果用人单位的行为被认定为违法，那么它需要支付被克扣的工资，并可能面临劳动监察部门的处罚。

2. 劳动者可获得经济补偿：

   • 在某些情况下，如用人单位违法解除劳动合同或未按照劳动合同约定支付劳动报酬等，劳动者还有权获得经济补偿。

举例说明：假设劳动者小张在某公司工作了4天，但只收到了3天的工资。如果小张与公司签订了劳动合同，且合同中没有约定可以扣款的情况，同时小张也没有违反公司规章制度或造成公司经济损失等情形，那么公司只发3天工资的行为就是违法的。小张可以先与公司协商，要求支付被克扣的工资；如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

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