核心结论：
三个月不上班，公司是否能开除员工，这并非一个简单的“是”或“否”的问题，而是需要根据具体情况来判断。以下我将从多个角度进行分析：
劳动合同及公司规章制度：
- 首先，需要查看劳动合同中是否有关于员工旷工或长期不上班的条款，以及公司规章制度中对此类情况的处理规定。如果合同或规章制度中明确规定了员工连续旷工达到一定天数（如三个月）可以被开除，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司有权依据此规定开除员工。
法律法规依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，员工严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。但这里的关键是“严重违反”，且规章制度需要合法有效。如果公司规章制度中关于旷工的规定过于严苛或不合理，可能被认定为无效，此时公司不能仅凭此规定开除员工。
- 另外，如果员工长期不上班是因为患病或非因工负伤，且在规定的医疗期内，那么公司不能依据旷工的规定开除员工。根据《劳动合同法》第四十二条，员工在医疗期内的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。
实际案例与司法实践：
- 在司法实践中，法院或仲裁机构会综合考虑多种因素来判断公司开除员工是否合法。例如，员工不上班的原因、是否提前告知公司、公司是否尽到通知义务、规章制度是否合法有效等。如果员工因不可抗力（如自然灾害、突发疾病等）导致无法上班，且及时告知了公司，那么公司可能不能仅凭此开除员工。
律师观点：
- 作为专业律师，我认为公司能否因员工三个月不上班而开除员工，取决于多个因素的综合考量。如果劳动合同或公司规章制度中有明确规定，且该规定合法有效，同时员工确实存在严重违反规章制度的行为，那么公司有权开除员工。但如果员工不上班的原因合理且合法，或者公司规章制度存在瑕疵，那么公司可能不能随意开除员工。
法律建议：
- 对于员工而言，如果因特殊原因无法上班，应及时告知公司并说明情况，尽量与公司协商解决。同时，要保留好相关证据，如医疗证明、请假条等，以备不时之需。
- 对于公司而言，应制定合法有效的规章制度，并明确规定员工旷工或长期不上班的处理方式。在开除员工前，应确保规章制度已经告知员工且员工已经签字确认，同时要尽到通知义务并保留好相关证据。
可能法律后果：
- 如果公司违法开除员工，员工有权向劳动仲裁机构或法院提起诉讼或仲裁申请，要求公司支付赔偿金或继续履行劳动合同等。因此，公司在处理此类问题时需谨慎行事，确保合法合规。
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