结论：工程未验收但实际投入使用，并不直接等同于在法律上被视为验收合格。这一行为会产生多方面的法律后果，包括视为工程已竣工、丧失对一般工程质量异议的权利、仍需支付工程款以及承包人承担地基基础工程和主体结构的保修责任等。同时，相关行政部门还可能对建设单位进行行政处罚。
一、法律原则与规定
强制性规定：
- 根据《中华人民共和国建筑法》第六十一条，建筑工程必须竣工验收合格后，方可交付使用；未经验收或验收不合格的，不得交付使用。这是法律的强制性规定，旨在确保建筑工程的安全性和合规性。
司法解释：
- 最高人民法院《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第十四条明确规定，建设工程未经竣工验收，发包人擅自使用后，又以使用部分质量不符合约定为由主张权利的，人民法院不予支持。这意味着发包人一旦擅自使用，即视为认可工程质量合格，或同意自行承担质量问题责任。但这并不意味着工程在法律上已被正式验收合格。
二、法律后果与责任划分
视为工程已竣工：
- 根据上述司法解释，建设工程未经竣工验收，发包人擅自使用的，以转移占有建设工程之日为竣工日期。这一规定对于确定承包人是否按时完成工程任务、是否存在逾期竣工等问题具有重要意义。
丧失对一般工程质量异议的权利：
- 发包人擅自使用未经验收的工程后，对于除地基基础工程和主体结构外的质量问题，通常无法再向承包人主张权利。这是因为发包人已经以实际行动表明接受了工程现状，并自愿承担由此可能带来的风险和后果。
仍需支付工程款：
- 即使工程未经验收就投入使用，承包人仍有权要求发包人按照合同约定支付工程价款。如果发包人以工程未验收为由拒绝支付，承包人可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式维护自己的权益。
承包人承担地基基础工程和主体结构的保修责任：
- 承包人仍需在建设工程的合理使用寿命内对地基基础工程和主体结构质量承担民事责任。这是因为这些关键部位的质量直接关系到整个工程的安全性和稳定性，不受发包人擅自使用的影响。
行政处罚：
- 对于建设单位未组织竣工验收就擅自交付使用的行为，相关行政部门可依据《建设工程质量管理条例》等法律法规进行处罚，包括责令改正、处工程合同价款百分之二以上百分之四以下的罚款；造成损失的，依法承担赔偿责任。
三、特殊情况下的责任判定
- 如果工程存在质量问题，且有充分证据证明该问题与发包人的擅自使用行为无关，承包人仍需对该质量问题承担责任。
- 对于涉及公共安全、环境保护等特殊领域的建设工程，即使发包人擅自使用，也不能简单视为验收合格。相关部门有权依法进行监督检查，并要求正式的竣工验收。
四、法律风险与建议
- 法律风险：甲方（发包人）未经验收即投入使用，可能面临工程质量纠纷、维修责任划分不清、行政处罚等法律风险。
- 建议：为避免上述风险，建议甲方严格遵守法律法规，待工程验收合格后再投入使用。这样不仅能确保工程质量和安全性，还能有效维护自身合法权益。如果工程确实需要提前投入使用，应与承包人协商并签订相关协议，明确双方的权利和义务。
综上所述，工程未经验收即投入使用，并不直接视为验收合格。发包人应充分了解相关法律后果和责任划分，谨慎行事以避免不必要的法律风险。如果您在建设工程领域遇到任何法律问题，欢迎直接向我咨询。