结论前置：
- 项目未验收但投入使用，在法律上通常会被视为竣工，但这一认定伴随着一系列法律后果和责任划分。
- 发包人擅自使用未验收工程，将丧失对一般工程质量异议的权利，但仍需支付工程款，且承包人需对地基基础工程和主体结构承担保修责任。
一、法律上的竣工认定
根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第十四条的规定，建设工程未经竣工验收，发包人擅自使用的，以转移占有建设工程之日为竣工日期。这一规定明确了在发包人擅自使用未验收工程的情况下，法律上将视为工程已经竣工。这种认定主要是为了确定承包人是否按时完成工程任务，以及是否存在逾期竣工等问题。
二、工程质量与责任划分
质量异议的限制：
- 发包人一旦擅自使用未验收工程，即视为认可工程质量合格，或同意自行承担质量问题责任。此后，发包人再以使用部分质量不符合约定为由主张权利的，人民法院将不予支持。
- 但需要注意的是，承包人仍需在合理使用寿命内对地基基础工程和主体结构质量负责。如果双方对工程质量是否属于地基基础和主体结构问题存在争议，应通过专业的工程质量鉴定机构进行鉴定。
实际案例：
- 在诚源置业公司与刘某的建设工程施工合同纠纷案中，诚源置业公司未经竣工验收擅自使用工程，并在诉讼中要求对工程质量进行鉴定。但由于其未能提交证据证明曾对工程质量提出异议，法院最终未支持其鉴定申请。
三、工程价款与支付责任
- 即使工程未经验收就投入使用，承包人仍有权要求发包人按照合同约定支付工程价款。如果发包人以工程未验收为由拒绝支付，承包人可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式维护自己的权益。法院或仲裁机构会根据实际情况，结合已完成工程的质量状况、工程量等因素，判定发包人支付相应的工程价款。
四、行政处罚与法律后果
- 对于建设单位未组织竣工验收就擅自交付使用的行为，相关行政部门可依据《建设工程质量管理条例》等法律法规进行处罚，包括责令改正、处工程合同价款百分之二以上百分之四以下的罚款；造成损失的，依法承担赔偿责任。
五、建议与指导
对于发包人：
- 应严格遵守法律法规，确保工程在竣工验收合格后再投入使用，以避免不必要的法律纠纷和经济损失。
- 在工程竣工后，应及时组织验收，并确保验收过程符合法律法规和合同约定。
对于承包人：
- 应确保工程质量符合合同约定和法律法规要求，并在工程竣工后及时办理验收手续，以保障自身权益。
- 如果发包人擅自使用未验收工程，承包人应保留相关证据，以便在后续纠纷中维护自己的权益。
在发生纠纷时：
- 双方应依法维护自身权益，优先考虑通过协商、调解等和解方式解决争议。
- 若无法和解，则可诉诸仲裁或诉讼，并准备好相关证据和法律依据。
综上所述，项目未验收但投入使用，在法律上通常会被视为竣工，但这一认定伴随着一系列法律后果和责任划分。因此，无论是发包人还是承包人，都应严格遵守相关法律法规和合同约定，确保工程的合法合规使用。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。