针对您提出的“员工癌症晚期公司要怎么处理”这一问题，我会从医疗期、工资及社保待遇、以及劳动合同处理三个方面进行详细解答。
一、医疗期
首先，员工确诊为癌症晚期后，根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，他们有权享受一定期限的医疗期。医疗期的具体时长取决于员工的实际工作年限和在本单位的工作年限。对于患特殊疾病（如癌症）的职工，在24个月内尚不能痊愈的，经企业和劳动主管部门批准，还可以适当延长医疗期。这意味着，癌症晚期的员工在医疗期内，公司不得随意解除劳动合同。
二、工资及社保待遇
在医疗期内，员工虽然停止工作进行治疗，但公司仍需按照劳动合同和集体合同的约定向他们支付病伤假工资。根据相关规定，病伤假工资不得低于当地最低工资标准的80%。同时，社保缴纳基数通常依据员工的实际工资来确定。在法定医疗期内，若员工的工资降低为最低工资标准的80%，社保缴纳基数也应相应调整。这样，员工在医疗期内既能获得一定的经济保障，又能保持社保的连续性。
三、劳动合同处理
医疗期满后的处理：如果员工在医疗期满后仍不能从事原工作，也不能从事由公司另行安排的工作，公司可以提前30日以书面形式通知员工本人或者额外支付1个月工资后，解除劳动合同。但这一操作必须严格遵守《劳动合同法》的相关规定，确保程序的合法性。
违法解除劳动合同的后果：如果公司在员工医疗期内或医疗期满后未按照法定程序解除劳动合同，可能构成违法解除。根据《劳动合同法》的规定，违法解除劳动合同的，公司需要支付赔偿金。赔偿金的数额通常根据员工的工作年限和工资水平来确定。
具体建议：
加强沟通：公司应与员工及其家属保持密切沟通，了解员工的病情和治疗情况，提供必要的支持和帮助。
依法处理：在处理员工癌症晚期相关事宜时，公司必须严格遵守相关法律法规和政策规定，确保员工的合法权益得到保障。
人文关怀：除了法律层面的处理外，公司还应体现人文关怀，如提供心理支持、协助申请医疗救助等，帮助员工及其家属度过难关。
综上所述，公司在处理员工癌症晚期相关事宜时，应综合考虑医疗期、工资及社保待遇、以及劳动合同处理等多个方面，确保依法合规、人文关怀并重。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，建议公司及时联系当地的人力资源和社会保障部门或专业律师。