当员工患上癌症时，公司应当依据相关法律法规和政策，妥善处理员工的医疗期、工资发放、社保缴纳以及劳动合同解除等问题。以下是一些详细的处理建议：
一、医疗期确定
根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，会根据其实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予3个月到24个月的医疗期。对于患特殊疾病（如癌症）的员工，在24个月内尚不能痊愈的，经企业和劳动主管部门批准，还可以适当延长医疗期。因此，公司应首先确定员工的医疗期长度，确保员工有足够的时间进行治疗和恢复。
二、工资发放
在医疗期内，公司应按照劳动合同和集体合同的约定向员工支付病伤假工资。根据《安徽省工资支付规定》等相关规定，病伤假工资不得低于当地最低工资标准的80%。这意味着，即使员工在医疗期内无法正常工作，公司也应保障其基本的生活需求。
三、社保缴纳
社保缴纳基数通常依据员工的实际工资来确定。在法定医疗期内，若员工的工资降低为最低工资标准的80%，社保缴纳基数也应相应调整。公司应确保员工的社保缴纳不受影响，保障员工在医疗期间的医疗保障和其他社保权益。
四、劳动合同解除
在医疗期内，公司不得随意解除与员工的劳动合同。如果员工在医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由公司另行安排的工作，公司可以提前30日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工1个月工资后，解除劳动合同。但需要注意的是，对于患特殊疾病的员工，如癌症，其医疗期可能较长，且在治疗期间可能无法从事任何工作。因此，公司在解除劳动合同时应格外谨慎，确保不违反相关法律法规和政策。
五、具体案例参考
以付某的案例为例，付某在入职后不久被确诊为直肠癌，并开始休病假。在医疗期内，公司以付某医疗期满未按时到岗为由解除劳动关系，但经仲裁委调解，公司最终支付了违法解除劳动合同赔偿金。这个案例提醒我们，公司在处理患癌员工的问题时，应严格遵守相关法律法规和政策，确保员工的合法权益不受侵害。
六、建议与沟通
综上所述，当员工患上癌症时，公司应依据相关法律法规和政策，妥善处理员工的医疗期、工资发放、社保缴纳以及劳动合同解除等问题。同时，公司还应与员工保持及时沟通，提供必要的帮助和支持，共同度过难关。