结论：公司店铺关门了，员工是否可以申请赔偿，这取决于多种因素，包括劳动合同的约定、公司关门的真实原因以及相关法律法规的规定。以下是从不同角度进行的分析：

一、劳动合同的约定

1. 合同终止条款：首先，需要查看劳动合同中是否有关于合同终止或解除的条款。如果合同中明确规定了在公司关门或经营不善等情况下，公司需要支付员工一定的经济补偿或赔偿，那么员工有权依据合同要求公司支付相应的款项。

2. 未约定情况：如果劳动合同中没有明确约定公司关门时的赔偿事宜，那么员工需要依据相关法律法规来维护自己的权益。

二、公司关门的真实原因

1. 合法解散或破产：如果公司是因为合法解散、破产等原因而关门，那么员工可能无法直接要求公司支付赔偿，但可以根据《企业破产法》等相关法律法规，参与公司的破产清算程序，以获取应得的工资、经济补偿等。

2. 非法关门或逃避债务：如果公司是因为非法关门、逃避债务等原因而关门，员工可以向劳动监察部门投诉，或者通过法律途径（如提起劳动仲裁或诉讼）来要求公司支付拖欠的工资、经济补偿等，并可能要求公司承担额外的赔偿责任。

三、相关法律法规的规定

1. 《劳动合同法》：根据《劳动合同法》的规定，公司因经营不善等原因需要裁员或解除劳动合同时，应当提前通知员工，并支付相应的经济补偿。经济补偿的标准通常根据员工在公司的工作年限和工资水平来确定。

2. 其他相关法律法规：除了《劳动合同法》外，还有《企业破产法》、《劳动争议调解仲裁法》等相关法律法规，员工可以根据具体情况选择适用。

四、建议与行动

1. 收集证据：员工应首先收集与公司关门相关的证据，如劳动合同、工资单、公司通知等，以便在后续的法律程序中证明自己的权益。

2. 咨询专业律师：由于法律问题具有复杂性和专业性，员工在面临公司关门等法律问题时，应及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见和帮助。

3. 采取法律行动：如果公司拒绝支付应得的赔偿或经济补偿，员工可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的权益。

举例说明：假设员工A在公司工作了5年，月工资为5000元。现在公司因为经营不善而关门，且劳动合同中没有明确约定公司关门时的赔偿事宜。根据《劳动合同法》的规定，公司应当支付员工A5个月工资作为经济补偿，即5000元/月 × 5月 = 25000元。如果公司拒绝支付，员工A可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来要求公司支付这笔款项。

最后，公司店铺关门了员工是否可以申请赔偿，需要根据具体情况来判断。如果你面临这样的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律意见和帮助。