针对您提出的“应届生三方协议作废后重新签三方提示已有协议是怎么回事”的问题，这通常是由于在三方协议作废后，原协议的信息可能并未完全从相关系统中清除，或者学校、用人单位的系统更新存在延迟，导致在尝试重新签订时系统仍识别到原有协议的存在。

详细解释与步骤：

1. 确认协议作废流程：

   • 首先，您需要确认三方协议的作废流程是否已经完全按照学校或用人单位的要求完成。这通常包括提交书面作废申请、获得相关方的同意、以及可能需要的盖章确认等步骤。

2. 联系学校就业指导中心：

   • 如果确认作废流程无误，但系统仍提示已有协议，建议您首先联系学校的就业指导中心或相关负责部门。他们通常负责管理学生的就业协议，并能提供关于协议状态的最准确信息。

3. 查询系统状态：

   • 学校就业指导中心可以查询您在就业系统中的协议状态，确认是否仍有未清除的旧协议记录。如果是系统问题，他们可以协助您联系技术部门进行修复或更新。

4. 与用人单位沟通：

   • 同时，您也应与之前签订协议的用人单位沟通，确认他们是否已收到并处理了您的作废申请。有时，用人单位的系统更新可能存在延迟，导致学校系统仍显示原有协议。

5. 重新签订流程：

   • 在确认旧协议已完全作废且系统状态更新后，您可以按照学校或用人单位的要求，重新开始签订新的三方协议。这通常包括填写新的协议表格、获得相关方的签字盖章等步骤。

6. 保留证据：

   • 在整个过程中，建议您保留所有与作废和重新签订协议相关的书面证据和通信记录。这些证据在将来可能出现的任何纠纷中都将起到关键作用。

额外建议：

• 及时沟通：在整个过程中，保持与学校就业指导中心和用人单位的及时沟通是非常重要的。这有助于您及时了解协议状态，避免不必要的延误和误解。
• 关注时间节点：注意学校或用人单位规定的协议签订和作废的时间节点。错过这些时间节点可能会导致您无法及时签订新的协议或面临其他不利后果。

希望以上解释和建议能帮助您解决当前的问题。如果仍有疑问或需要进一步的帮助，请随时联系学校就业指导中心或相关负责部门。