关于群众拿用工单位的资料来办理健康证时，医院是否需要保留这些资料的问题，这主要取决于当地的具体规定和医院的实际操作流程。不过，我可以根据一般情况和相关法规给您一个较为全面的解答。
首先，根据《公共场所卫生管理条例》、《食品安全法》等法律规定，公共场所（直接为顾客服务、从事供管水和涉水产品、餐饮具集中消毒、消毒产品生产）以及直接从事食品药品、化妆品生产、药械生产经营等依法需要进行预防性健康体检的从业人员，是需要办理健康证的。在办理过程中，通常需要提供一些必要的材料，如身份证原件及复印件、营业执照/卫生许可证复印件（加盖公章）、用工（在职）证明以及本人一寸免冠照片等。
针对您提出的问题，医院在办理健康证时，一般会对提供的用工单位资料进行审核，但并不一定会长期保留这些资料的原件。医院可能会要求您提供这些资料的复印件作为办理健康证的依据，并在审核无误后，将这些复印件作为办理健康证的档案材料进行留存。而原件，如营业执照、卫生许可证等，通常会在审核后退还给您或用工单位。
此外，随着电子化办公的普及，现在很多地区都推出了电子健康证服务。您可以通过手机等电子设备在线预约、查询和领取健康证，这大大简化了办理流程，也减少了纸质材料的留存。在这种情况下，医院可能只需要您提供电子版的用工单位资料或相关信息进行审核，而无需留存纸质原件。
总结来说：
为了确保办理流程的顺利进行，建议您在前往医院办理健康证前，先咨询当地医院或相关部门的具体要求，了解需要提供哪些材料以及这些材料是否需要留存。这样可以帮助您更好地准备材料，避免不必要的麻烦。